您好，针对您提出的问题“我的女儿跟她妈姓，怎么证明父子关系”，以下是我为您提供的详细解答：
要证明父子关系，即使女儿跟随母亲姓氏，您依然可以通过以下几种方式来进行证明：
一、亲属关系公证
准备材料：
- 您的有效身份证件（如居民身份证）。
- 您的《居民户口簿》，如果是集体户籍，则提供《常住人口登记卡》本人页。
- 如果需要委托他人代办，还需提供受托人的身份证件和手写委托书。
- 亲属关系证明信，这可以由户籍地派出所或档案存放单位出具，以证明您与女儿之间的父子关系。
特殊情况说明：
- 如果您之前办理过出生公证或亲属关系公证，可以提供原出生公证书或亲属关系公证书作为证明。
- 如果您有《出生医学证明》或《独生子女证》，并且这些证件内容完整、无涂改，也可以作为证明材料。但请注意，如果证件内容有缺项、涂改或填写字迹不一致，则不能作为唯一证据使用，还需提供其他证明材料。同时，提供这些证件时，还需提供您与女儿母亲的结婚证。
办理流程：
- 携带上述材料到公证机构申请办理亲属关系公证。
- 公证机构会依法审核您的材料，并出具亲属关系公证书。
二、户籍证明
如果您的居民户口簿上足以证明您与女儿的父子关系，但某些社会事务需要更明确的证明，您可以向户籍地公安机关申请出具户籍证明。
准备材料：
- 书面申请报告，陈述您的事由及线索。
- 您的居民身份证。
办理流程：
- 携带上述材料到户政窗口申请。
- 公安机关会受理并调查，通常在5个工作日内办结，并出具户籍证明。
三、注意事项
- 无论选择哪种方式证明父子关系，都请确保提供的材料真实、完整、有效。
- 如果公证机构或公安机关要求补充材料，请积极配合并提供所需材料。
- 亲属关系公证书或户籍证明在办理某些社会事务时可能具有法律效力，请妥善保管。
希望以上解答能够帮助您解决问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。