当遇到合伙人侵占合伙财产且该行为不构成犯罪的情况时，赔偿问题可以通过以下步骤来处理：

一、协商解决

首先，建议受侵害的合伙人与侵占方进行友好协商。在协商过程中，明确要求侵占方返还被侵占的合伙财产，并就因侵占行为导致的损失进行赔偿。协商时，可以提出具体的赔偿方案和返还时间表，以促成双方达成一致。

二、收集证据

若协商无果，受侵害的合伙人需要开始收集相关证据，以证明侵占事实的存在。这些证据可能包括：

1. 合伙协议：证明合伙关系的存在以及各合伙人对合伙财产的权益。
2. 财务报表和交易记录：显示合伙财产的流动情况，以及被侵占的具体财产和金额。
3. 沟通记录：如邮件、短信、聊天记录等，证明曾尝试与侵占方协商但未果。
4. 其他相关证据：如证人证言、照片、视频等，能够辅助证明侵占事实。

三、提起民事诉讼

在收集到充分证据后，受侵害的合伙人可以向有管辖权的法院提起民事诉讼。诉讼时，需要明确诉讼请求，包括要求侵占方返还被侵占的财产、赔偿因侵占行为导致的损失等。同时，需要提交收集到的证据，以支持自己的诉讼请求。

四、遵循法定程序

在诉讼过程中，受侵害的合伙人需要遵循法定程序，如按时提交诉状、参加庭审、遵守法庭纪律等。同时，也可以考虑聘请专业律师来代理诉讼，以提高诉讼效率和胜诉率。

五、执行判决

若法院最终判决侵占方需要返还财产并赔偿损失，侵占方应履行判决义务。若侵占方拒不履行，受侵害的合伙人可以向法院申请强制执行，通过法律手段来维护自己的合法权益。

六、注意事项

1. 诉讼时效：根据法律规定，民事诉讼的诉讼时效通常为三年。因此，受侵害的合伙人需要在知道或应当知道权利被侵害之日起三年内提起诉讼。
2. 证据保全：在收集证据的过程中，需要注意证据的保全和固定，以防止证据丢失或被篡改。
3. 法律咨询：在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师的意见，以确保自己的合法权益得到充分保障。

综上所述，当合伙人侵占合伙财产且不构成犯罪时，受侵害的合伙人可以通过协商、收集证据、提起民事诉讼等途径来维护自己的合法权益。