公司让员工去分公司签协商协议，这一行为本身并不直接违法，但具体是否合法需结合实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 协议签订地点的合法性

• 一般原则：法律并未明确规定协商协议必须在公司总部签订。只要协议内容合法、双方自愿，且签订过程符合法定程序（如双方签字盖章、不存在欺诈胁迫等），签订地点通常不影响协议效力。
• 例外情形：若分公司无独立法人资格，且协议涉及分公司无权处理的事项（如超出分公司经营范围的权益），则可能因主体不适格导致协议无效。但若分公司经总部授权，或协议内容仅涉及分公司权限范围内的事项，则签订地点合法。

2. 需重点核查的内容

• 分公司权限：确认分公司是否具有独立签订协议的权限。若分公司无独立法人资格，需总部授权或事后追认，否则协议可能因主体不适格而无效。
• 协议内容合法性：协议条款是否违反法律强制性规定（如最低工资标准、社保缴纳等）。若协议内容违法，即使签订地点合法，协议也可能被认定无效。
• 员工自愿性：员工是否在完全自愿的情况下签订协议，是否存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形。若员工非自愿签订，协议可被撤销。

3. 法律建议

• 核查分公司资质：要求公司提供分公司的营业执照或授权文件，确认分公司是否具有独立签订协议的权限。
• 审查协议内容：仔细阅读协议条款，确保内容合法、明确，无模糊或歧义条款。必要时可要求公司解释条款含义。
• 保留证据：签订协议时，保留相关证据（如沟通记录、协议文本等），以备后续维权之需。
• 咨询专业律师：若对协议内容或签订过程有疑问，建议及时咨询专业律师，避免因疏忽导致权益受损。

4. 可能的法律后果

• 协议有效：若分公司具有权限、协议内容合法且员工自愿签订，则协议有效，双方需按协议履行义务。
• 协议无效或可撤销：若分公司无权限、协议内容违法或员工非自愿签订，则协议可能被认定无效或可撤销，员工可要求重新协商或通过法律途径维权。

总结：公司让员工去分公司签协商协议，关键在于分公司是否具有权限、协议内容是否合法以及员工是否自愿。建议您在签订前仔细核查相关资质和协议内容，必要时咨询专业律师。若您在此过程中遇到任何问题，可直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。