实际施工人亏损后，挂靠公司是否会赔偿，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、挂靠协议的约定

1. 有明确约定时：

   • 如果挂靠协议中明确约定了在实际施工人亏损时，挂靠公司需要承担一定的赔偿责任或提供经济支持，那么挂靠公司应当按照协议约定履行义务。
   • 这种情况下，实际施工人可以依据挂靠协议向挂靠公司主张权利。

2. 无明确约定时：

   • 如果挂靠协议中没有明确约定亏损时的赔偿责任，那么挂靠公司通常没有法定的赔偿义务。
   • 此时，实际施工人难以直接依据挂靠协议要求挂靠公司赔偿。

二、挂靠行为的合法性

1. 合法挂靠：

   • 如果挂靠行为本身符合法律法规的规定，且挂靠协议合法有效，那么双方应当按照协议约定履行各自的权利和义务。
   • 但即便如此，没有协议约定的情况下，挂靠公司也无赔偿亏损的法定义务。

2. 非法挂靠：

   • 如果挂靠行为违反了法律法规的规定，如未取得相应资质而挂靠、挂靠协议无效等，那么实际施工人可能面临更大的法律风险。
   • 在这种情况下，实际施工人不仅难以要求挂靠公司赔偿亏损，还可能因非法挂靠行为而承担法律责任。

三、实际施工人的过错程度

1. 无过错或过错较小：

   • 如果实际施工人在施工过程中没有过错或过错较小，且亏损是由于不可抗力、市场变化等不可归责于双方的原因造成的，那么挂靠公司可能基于公平原则或人道主义考虑，给予一定的经济支持或协助。
   • 但这并非法律义务，而是挂靠公司的自愿行为。

2. 存在较大过错：

   • 如果实际施工人在施工过程中存在较大过错，如管理不善、资金挪用等，导致亏损发生，那么挂靠公司通常不会承担赔偿责任。
   • 此时，实际施工人应当自行承担亏损后果。

四、法律建议

1. 审查挂靠协议：

   • 实际施工人在与挂靠公司签订挂靠协议时，应当仔细审查协议条款，明确双方的权利和义务，特别是关于亏损时的赔偿责任条款。

2. 遵守法律法规：

   • 实际施工人应当遵守相关法律法规的规定，确保挂靠行为的合法性，避免因非法挂靠行为而承担法律责任。

3. 及时寻求法律帮助：

   • 如果在实际施工过程中发生亏损或其他纠纷，实际施工人应当及时寻求法律帮助，了解自己的权利和义务，以便采取合适的法律措施维护自己的合法权益。

如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。