在主债权诉讼时效已届满的情况下，抵押人通常有权要求涤除抵押权登记。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》第四百一十九条：
- 抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权；未行使的，人民法院不予保护。
《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉有关担保制度的解释》第四十四条：
- 主债权诉讼时效期间届满后，抵押权人主张行使抵押权的，人民法院不予支持；
- 抵押人以主债权诉讼时效期间届满为由，主张不承担担保责任的，人民法院应予支持。
二、法律分析
抵押权行使的时效性：
- 根据上述法律规定，抵押权人必须在主债权的诉讼时效期间内行使抵押权。如果抵押权人未在此时效期间内行使抵押权，那么其抵押权将不再受到法律的保护。
抵押人涤除抵押权登记的权利：
- 在主债权诉讼时效已届满的情况下，抵押人可以主张涤除抵押权登记。这是因为，抵押权已无所依附，无法再行使。如果不允许抵押人涤除抵押权登记，将会使抵押人长期处于不确定状态，既不能使当事人从抵押关系中摆脱出来，也不能实现抵押物的物尽其用。
立法本意和目的：
- 无论是《民法典》还是相关司法解释，其立法本意和目的均系为督促抵押权人积极行使抵押权利，迅速了结债权债务关系，发挥抵押财产的经济效用，并维系社会经济秩序的稳定。当抵押权人怠于行使抵押权时，将损害抵押人的利益。因此，对抵押权人行使抵押权的期限进行限制是必要的。
三、司法实践
- 在司法实践中，当主债权诉讼时效已届满时，法院通常会支持抵押人涤除抵押权登记的请求。例如，在海南省定安县人民法院和海南省第一中级人民法院的判决中，均支持了抵押人涤除抵押权登记的诉讼请求。
四、注意事项
- 抵押人需及时主张权利：虽然抵押人在主债权诉讼时效已届满时有权要求涤除抵押权登记，但抵押人仍需及时主张这一权利，以避免不必要的法律纠纷。
- 抵押权人可能提出的抗辩：抵押权人可能会以各种理由提出抗辩，试图阻止抵押人涤除抵押权登记。因此，抵押人在主张权利时，应准备充分的证据和法律依据。
建议：如果您作为抵押人，面临主债权诉讼时效已届满而抵押权人未行使抵押权的情况，您可以及时向法院提起诉讼，要求涤除抵押权登记。在诉讼过程中，您应提供充分的证据证明主债权诉讼时效已届满，并引用相关法律规定支持您的诉讼请求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。