结论前置：员工提前三十日以书面形式通知用人单位后，无论公司是否批准，劳动合同在通知期满后即视为解除，员工有权合法离职。若公司阻挠或拒绝办理离职手续，员工可通过沟通协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等法律途径维护自身权益。
详细分析：
一、员工提前三十日书面通知离职的法定权利
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条：“劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。”这一规定明确了劳动者享有提前三十日书面通知解除劳动合同的法定权利，且该权利无需用人单位批准。因此，员工在提前三十日以书面形式通知公司后，无论公司是否批准，三十日期满后，员工均有权自行离职。
二、公司不批准离职申请的处理方式
确保书面通知及保留证据：
- 员工应以书面形式（如辞职信、电子邮件等）正式通知公司离职意愿及具体日期。
- 使用邮政特快专递（EMS）邮寄辞职信时，需在快递单上明确标注“辞职信”及日期，并保存快递底单和物流信息作为证据。
- 通过公司认可的工作邮箱发送离职邮件时，应清晰表达离职意愿和日期，并妥善保存邮件发送记录。
到期正常离职与交接：
- 在提前三十日书面通知后，员工应按公司规定的离职流程办理工作交接等手续。
- 无论公司是否批准，三十日期满后，员工均有权自行离职。若公司以不批准为由拒绝办理离职手续，员工可继续主张自己的权利。
公司阻挠的应对措施：
- 沟通协商：首先尝试与公司人力资源部门或上级领导进行沟通，解释离职原因，强调依法享有解除劳动合同的权利，要求公司配合办理离职手续。
- 向劳动监察部门投诉：若沟通无果，公司仍拒绝办理离职手续或以其他方式阻挠，员工可向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门将对公司行为进行调查，并责令其改正违法行为。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：若劳动监察部门的处理未能解决问题，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求确认劳动关系已解除，并请求公司办理离职手续、出具解除劳动合同证明、支付工资及办理档案和社会保险关系转移等。如公司行为给员工造成损失，还可要求赔偿。在必要时，员工可考虑寻求法律援助或向法院提起诉讼。
三、公司可能面临的法律后果
若公司违反法律规定，拒绝办理离职手续或克扣工资等，将可能面临以下法律后果：
- 劳动监察部门的处罚：劳动监察部门有权对公司进行调查，并责令其改正违法行为。如公司拒不改正，可能面临罚款等行政处罚。
- 劳动争议仲裁或诉讼的败诉风险：若员工申请劳动仲裁或提起诉讼，公司可能因违反法律规定而败诉，需承担支付工资、经济补偿、赔偿金等法律责任。
- 声誉损失：公司的违法行为可能对其声誉造成负面影响，影响其与员工、客户及合作伙伴的关系。
总结：在面对公司不批准离职申请的情况时，员工应保持冷静理性，依据法律法规采取适当措施维护自身权益。通过确保书面通知、保留证据、沟通协商、向劳动监察部门投诉以及申请劳动仲裁或提起诉讼等步骤，员工可以有效地应对公司的不合理行为，保护自己的合法权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。