关于员工在企业退休后其档案在企业能保存多少年的问题，这并非由一个统一的法律规定来直接确定，而是需要结合档案的性质、企业的实际情况以及相关的法律法规来综合考量。不过，我可以根据现有的法律法规和实践操作，为您提供一个清晰且详细的解答。

首先，从法律法规的层面来看，《中华人民共和国档案法》及其《实施办法》强调了档案的重要性和管理要求。虽然这些法规并未直接针对退休档案提出具体的保存年限，但它们明确了档案应根据其价值进行不同期限的保存，特别是那些具有长远利用价值的历史记录，应被永久保存。退休档案作为职工工作历程和退休情况的真实记录，不仅关乎个人的养老金待遇核定、调整等权益，也是处理劳动纠纷、认定参加工作时间的重要依据，因此具有显著的历史价值和法律意义。

其次，从实践操作的角度来看，《企业职工档案管理工作规定》要求企业对于离职、退休等职工的档案进行妥善保管，并明确了档案的管理和利用等相关事项。这一规定虽然未直接设定保存期限，但强调了档案长期保存的必要性。在实际操作中，各企业和机构往往会根据自身情况和需要制定具体的档案管理规定，这些规定通常都会包含对退休档案长期或永久保存的要求。

综合以上分析，我们可以得出结论：员工在企业退休后，其档案应当被企业进行长期甚至永久的保存。这不仅是法律法规的应有之义，也是保障退休人员合法权益、维护社会稳定的必然要求。

当然，企业在处理退休档案时，也应确保档案的完整性和安全性，防止档案丢失或损坏。如果企业因特殊原因无法继续保存退休档案，应按照相关规定将档案转交给具有档案管理权限的机构进行保存。

最后，我建议您在涉及退休档案相关事宜时，如果仍有疑问或需要更具体的指导，可以咨询当地的档案管理部门或专业律师，以获取更准确和全面的帮助。