非法占用农用地后补办手续的行为定性需分情况讨论，具体如下：

1. 若补办手续前已构成非法占用农用地罪，补办行为不影响犯罪成立

根据《刑法》第三百四十二条及司法解释，非法占用农用地罪的构成要件为：违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏。

• 关键点：犯罪行为在补办手续前已完成（如未经批准擅自改变土地用途、毁坏农用地），补办手续仅是事后补救措施，无法改变此前行为的违法性。
  
• 例外情形：若补办手续后，被占用的农用地通过复垦、修复等措施恢复原状，且未造成严重后果，可能作为量刑情节从轻处罚，但不影响定罪。

2. 若补办手续符合法定程序且未造成实质损害，可能不构成犯罪

若行为人在占用农用地后，及时补办用地审批手续（如取得农用地转用审批、土地使用证等），且符合以下条件，可能不构成非法占用农用地罪：

• 补办手续合法有效：补办的审批程序、用地范围、用途等均符合《土地管理法》《森林法》等法律法规要求；
  
• 未造成农用地毁坏：占用行为未导致耕地、林地等农用地种植条件严重恶化或生态功能丧失；
  
• 无主观故意：行为人无非法占用目的，仅因程序疏忽或政策理解偏差导致未及时办证。
  
• 注意：实践中，此类情形需结合具体证据（如审批文件、土地现状评估报告等）综合判断，司法机关可能以“行政违法”而非“刑事犯罪”处理。

3. 补办手续可能影响量刑，但需区分“程序违法”与“实质违法”

即使补办手续，若占用行为本身存在以下情形，仍可能被认定为犯罪：

• 占用数量超标：如实际占用面积远超审批范围；
  
• 用途违法：补办手续后仍改变农用地用途（如将耕地转为建设用地）；
  
• 造成严重后果：如导致农用地无法复垦、生态功能永久丧失。
  
• 量刑影响：补办手续可能作为“认罪态度好”“积极消除影响”的情节，在量刑时予以考虑，但无法完全免除刑事责任。

实务建议

1. 立即停止违法行为：若尚未补办手续，应立即停止占用并恢复土地原状；
   
2. 主动补办手续：在符合条件的情况下，尽快向自然资源部门申请补办用地审批；
   
3. 咨询专业律师：结合具体案情（如占用面积、用途、补办进度等），评估刑事风险并制定应对方案。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细分析。