要证明居间费用已经付清且合同已结清，您可以从以下几个方面着手收集和提供证据：

一、书面证据

1. 居间合同文本：首先，您需要保留与委托方及第三方签订的三方居间合同文本。这份合同应详细记载了居间服务的内容、双方的权利义务、居间报酬的支付方式和条件等关键信息。合同上双方签字盖章后，即具有法律效力，是证明居间合同存在和内容的重要依据。

2. 结清证明或确认书：如果可能的话，您可以要求委托方出具一份结清证明或确认书，明确表明居间费用已经付清，且双方对居间合同的履行均无异议。这份文件应由委托方签字盖章，以增强其证明力。

二、支付凭证

1. 转账记录：您需要保留委托方支付居间报酬的转账记录。这些记录可以是银行转账凭证、电子支付截图等，能够直观显示资金流向和支付时间，是证明居间费用已经支付的重要证据。

2. 收据或发票：如果委托方在支付居间费用时提供了收据或发票，您也应妥善保管。这些文件能够进一步证明您已经收到了居间费用，并且是合法合规的。

三、通信记录

1. 邮件、短信、微信聊天记录：在居间合同履行过程中，您与委托方之间可能会有大量的邮件、短信、微信聊天记录。这些记录中可能涉及居间服务的协商、进展、成果确认等内容。您可以整理这些记录，特别是那些与居间费用支付和合同结清相关的部分，作为证明合同履行的辅助证据。

四、证人证言

1. 参与交易的相关人员：如果可能的话，您可以寻找参与交易的相关人员（如第三方）作为证人。他们的证言可以辅助证明您已经履行了居间合同义务，并且居间费用已经付清。在收集证人证言时，应注意证人的可信度和证言的真实性。

五、综合证据

在证明居间合同结清时，您应尽可能提供多方面的证据来相互印证。例如，您可以同时提供书面合同、支付凭证、通信记录和证人证言等，以形成一个完整的证据链。这样能够更有力地证明居间合同的履行情况和居间费用的结清情况。

注意事项

• 在收集证据时，应注意证据的合法性、真实性和关联性。不要收集或提供虚假证据，以免给自己带来不必要的法律风险。
• 如果可能的话，您可以考虑在合同中约定一些具体的证明条款，如要求委托方在支付居间费用后出具结清证明等。这样可以在一定程度上简化证明过程。
• 如果您在证明过程中遇到困难或疑问，可以咨询专业的法律人士或律师，以获取更具体的指导和帮助。