违法所得的计算通常不应包含配送费，除非配送费被明确认定为违法所得的一部分。以下是对此问题的详细分析：
一、违法所得的定义与计算原则
违法所得，通常指的是因违反法律、行政法规的规定而获得的财产性利益。在计算违法所得时，一般应遵循“实际获得”原则，即只计算行为人因违法行为而实际获得的财产性利益。配送费，作为商品销售过程中的一项附加费用，其性质取决于具体的销售模式和合同约定。
二、配送费是否应计入违法所得的分析
配送费作为独立服务费用：
- 如果配送费是作为独立的、与医疗器械销售相分离的服务费用收取的，且该费用本身并不涉及违法行为（如超范围经营、无证经营等），则配送费通常不应计入违法所得。
- 在这种情况下，配送费是消费者为获得商品配送服务而支付的对价，与医疗器械销售的违法性无直接关联。
配送费作为销售价格的一部分：
- 如果配送费被隐含在医疗器械的销售价格中，或者作为销售价格的一部分进行收取，且该销售行为本身被认定为违法（如销售未经注册的医疗器械），则配送费可能被视为违法所得的一部分。
- 这是因为，在这种情况下，配送费实际上是违法销售行为所获得的财产性利益的一部分。
特殊情况下的考虑：
- 如果配送费的收取与违法行为存在直接关联（如通过提高配送费来掩盖违法销售的高额利润），则配送费可能被视为违法所得的组成部分。
- 此外，如果相关法律法规或司法解释明确规定配送费应计入违法所得，则应遵循这些规定。
三、法律建议与风险提示
明确销售模式与合同约定：
- 在网络销售医疗器械时，应明确销售模式与合同约定，确保配送费的收取与医疗器械销售的合法性相分离。
- 避免将配送费隐含在销售价格中，以减少被认定为违法所得的风险。
遵守相关法律法规：
- 严格遵守《医疗器械监督管理条例》等相关法律法规的规定，确保医疗器械的销售行为合法合规。
- 定期对销售行为进行自查自纠，及时发现并纠正可能存在的违法行为。
寻求专业法律意见：
- 在涉及违法所得计算等复杂法律问题时，建议寻求专业律师的法律意见。
- 律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助降低法律风险。
如有任何关于医疗医患领域（包括医疗事故责任及赔偿）的法律问题，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。