针对您提出的“离婚协议写100万，女方起诉怎么办”的问题，这涉及到离婚协议的法律效力以及后续可能出现的诉讼情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、离婚协议的法律效力
首先，需要明确的是，离婚协议是双方自愿、平等协商后达成的，具有法律约束力。一旦双方在民政局登记离婚，该协议即生效，双方应按照协议内容履行各自的义务。在您提到的案例中，离婚协议明确约定了男方需支付女方100万元的经济补偿。
二、女方起诉的可能情况及应对
女方首次起诉部分金额：
- 如果女方首次仅起诉要求男方支付部分金额（如50万元），这是女方对自己权利的处分，不违反法律规定。法院会根据双方提供的证据和法律规定，判决男方支付相应的金额。
- 在此情况下，男方应积极应诉，提供相关证据证明自己的支付能力或提出合理的抗辩理由。
女方后续起诉剩余金额：
- 如果女方在首次起诉后，又对剩余金额（如另外50万元）提起诉讼，这取决于女方是否在首次起诉时明确表示放弃剩余债权，以及双方是否在后续协商中达成新的协议。
- 根据相关法律规定，权利人对同一债权中的部分债权主张权利，诉讼时效中断的效力及于剩余债权，但权利人明确表示放弃剩余债权的情形除外。因此，如果女方在首次起诉时或后续协商中明确表示放弃剩余债权，则可能无法再对剩余金额提起诉讼。
- 如果女方未明确表示放弃，且能提供证据证明其在诉讼时效期间内向男方主张过权利，则法院可能会支持女方的诉讼请求。
三、应对建议
审查离婚协议及后续协议：
- 男方应仔细审查离婚协议及后续可能达成的任何协议，确保自己清楚了解并同意其中的条款。
- 如果发现协议中有不明确或存在争议的地方，应及时与女方协商解决，或寻求法律帮助。
保留相关证据：
- 男方应保留与女方沟通、协商的所有记录，包括短信、微信、录音等，以备不时之需。
- 如果男方已经支付了部分或全部补偿款，应保留支付凭证作为证据。
积极应诉：
- 如果女方提起诉讼，男方应积极应诉，提供相关证据证明自己的立场和抗辩理由。
- 男方可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保护。
四、总结
离婚协议是双方自愿达成的具有法律约束力的文件。如果女方在离婚后对协议中的经济补偿款提起诉讼，男方应仔细审查协议内容、保留相关证据并积极应诉。同时，双方也应尽量通过协商解决争议，以避免不必要的法律纠纷和成本。希望以上解答能对您有所帮助。