商贸公司可以签订运输合同。以下从法律背景、合同有效性及实践建议三个角度进行详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，执行法人工作任务的人员，在其职权范围内以法人名义实施的民事法律行为，对法人发生效力。商贸公司作为独立的法人实体，其工作人员在授权范围内以公司名义签订的运输合同，属于职务行为，该合同对商贸公司具有法律约束力。同时，运输合同是明确承运人与托运人之间权利义务关系的协议，商贸公司作为托运人或委托人，有权与承运人签订此类合同。

合同有效性

商贸公司签订的运输合同，在满足以下条件时，通常被认定为有效：

1. 合同内容合法：合同条款应符合法律法规的规定，不得违反国家限制经营、特许经营及法律、行政法规禁止经营的规定。
2. 双方意思表示真实：合同双方应基于真实意愿签订合同，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 不违反公司内部规定：商贸公司签订运输合同应遵守公司章程及内部管理制度，确保合同行为符合公司利益。

实践建议

为确保商贸公司签订的运输合同合法有效，并降低潜在的法律风险，以下是一些实践建议：

1. 明确授权范围：商贸公司应确保签订运输合同的工作人员具有明确的授权，避免无权代理或超越代理权限的情况发生。
2. 仔细核对合同条款：在签订合同前，商贸公司应仔细核对合同条款，确保合同内容明确、具体，避免模糊不清或存在歧义的条款。
3. 选择有资质的承运人：商贸公司应选择具有合法运输资质、信誉良好的承运人进行合作，以降低运输过程中的风险。
4. 及时咨询专业律师：如遇复杂或不确定的法律问题，商贸公司应及时咨询专业律师，以确保自身行为的合法性和合规性。

举例说明：假设某商贸公司需要从A地运输一批货物至B地，该公司可以与具有合法运输资质的物流公司签订运输合同，明确运输路线、运费、运输期限等条款。在合同履行过程中，如发生货物损坏、丢失等情况，商贸公司可以依据合同条款向物流公司主张权利。

综上所述，商贸公司可以签订运输合同，但应确保合同内容合法、双方意思表示真实，并遵守公司内部规定。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。