结论：时隔五年，对于网上诈骗6000元且当时已退赃的情况，是否还会被抓捕，取决于多种因素，包括案件是否已被立案、是否已过追诉时效、以及是否有新的证据或线索出现等。以下从不同角度进行详细分析。

一、案件是否已被立案

1. 若案件已被立案：

   • 公安机关在立案后，会依法进行侦查，包括收集证据、传唤嫌疑人等。即使嫌疑人当时已退赃，但如果案件尚未结案，且嫌疑人未被采取强制措施（如取保候审、监视居住等），或者虽被采取强制措施但后续被解除或变更，那么在案件未彻底终结前，嫌疑人仍有可能被再次抓捕。
   • 特别是如果案件在五年内一直处于侦查阶段，或者虽然侦查阶段结束但进入了审查起诉、审判阶段，那么嫌疑人被抓捕的风险仍然存在。

2. 若案件未被立案：

   • 如果当时诈骗行为未被公安机关发现或未达到立案标准（如诈骗金额未达到当地规定的刑事立案标准，但6000元通常已达到多数地区的刑事立案标准），或者虽然发现但未予立案，那么五年后一般不会再因同一事实被抓捕。
   • 但需要注意的是，如果后续有新的证据或线索出现，证明该诈骗行为确实存在且达到刑事立案标准，那么公安机关仍有可能立案并抓捕嫌疑人。

二、是否已过追诉时效

• 根据《中华人民共和国刑法》第八十七条的规定，犯罪经过下列期限不再追诉：

  • （一）法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；
  • （二）法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年；
  • （三）法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年；
  • （四）法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。

• 对于诈骗罪，如果诈骗数额较大（如6000元），通常处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。因此，其追诉时效为五年。如果时隔五年后，没有新的证据或线索出现，且案件未被持续侦查，那么一般可以认为已过追诉时效，不再追诉。

• 但需要注意的是：如果诈骗行为被认定为“数额巨大”或有其他严重情节，法定最高刑可能超过五年，那么追诉时效也会相应延长。此外，如果案件在五年内一直处于持续状态（如持续诈骗、逃避侦查等），那么追诉时效可能从行为终了之日起计算，而非从犯罪之日起计算。

三、是否有新的证据或线索出现

• 即使案件已过追诉时效或原本未被立案，但如果后续有新的证据或线索出现，证明该诈骗行为确实存在且达到刑事立案标准，那么公安机关仍有可能立案并抓捕嫌疑人。

法律建议

1. 如果担心被抓捕：

   • 可以主动向公安机关了解案件情况，包括是否已被立案、案件进展等。
   • 如果案件已被立案且自己尚未被采取强制措施，可以考虑主动投案自首，以争取从轻或减轻处罚。

2. 如果已被抓捕或面临抓捕风险：

   • 应及时委托专业律师提供法律帮助，包括申请取保候审、进行无罪或罪轻辩护等。

总结：时隔五年，对于网上诈骗6000元且当时已退赃的情况，是否还会被抓捕取决于案件是否已被立案、是否已过追诉时效以及是否有新的证据或线索出现等多种因素。如果有任何法律问题或担忧，可以直接向我咨询。