总价包干合同中，土方与桩基工程一般不需要按实结算，但存在例外情形。具体分析如下：

1. 总价包干合同的本质
   总价包干合同（固定总价合同）的核心是“总价固定、风险包干”，即合同价款在约定范围内不因工程量增减、设计变更等因素调整，除非合同明确约定或发生法定调整事由。因此，若合同明确约定土方与桩基工程纳入总价包干范围，且未设置调整条款，则无需按实结算。

2. 例外情形：需按实结算的情况

   • 合同明确约定调整机制：若合同中约定“土方工程量超过设计量10%时，超出部分按实结算”或“桩基工程因地质条件变化导致工程量增加，按实际发生调整”，则需按合同约定执行。
     
   • 设计变更或发包人原因导致工程量变化：根据《民法典》第533条（情势变更）及建设工程司法解释，若因发包人设计变更、地质条件与勘察报告严重不符等非承包人原因导致工程量大幅增加，承包人可主张调整价款。
     
   • 合同无效或被撤销：若合同因违反法律强制性规定（如未招标、无资质施工）被认定无效，则可能按实际工程量结算，但需以法院或仲裁机构裁决为准。

3. 实务建议

   • 审查合同条款：重点核查“工程范围”“价款调整”“风险分担”等条款，明确土方与桩基是否纳入包干范围及调整条件。
     
   • 固定证据：若发生工程量变化，及时留存设计变更单、地质勘察报告、施工日志等证据，以备主张调整价款。
     
   • 协商与诉讼：若与发包人协商无果，可依据合同约定或法律规定，通过诉讼或仲裁解决争议。

结论：总价包干合同下，土方与桩基工程原则上按合同总价结算，但需结合合同条款及实际履行情况判断是否存在调整事由。如有具体合同文本或纠纷，可进一步提供细节，我将为您详细分析。