在一般情况下，未经特殊审批且未依法支付加班工资或安排补休的保安12小时制两班倒工作制度是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与工时标准
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是保障劳动者休息权益的基本规定，也是判断保安工作制度是否合法的核心依据。保安12小时制两班倒的工作制度，显然超出了这一法定工作时间限制。
二、特殊情况下的工时延长
尽管存在标准工时制度，但《中华人民共和国劳动法》第四十一条也规定了特殊情况下的工时延长条件。即用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下，延长工作时间每日不得超过三小时，且每月不得超过三十六小时。然而，这些延长工时的规定并不能成为常态，且必须依法进行，同时还需要支付相应的加班工资或安排补休。
三、保安工作的特殊性并不构成违法理由
保安工作因其安保任务繁重、需要连续值班等特点，确实具有一定的特殊性。但这并不能成为违反劳动法规定工作时间的理由。用人单位应与保安人员协商确定合理的工作时间和休息安排，确保保安人员的身心健康和合法权益不受侵犯。如果用人单位强制要求保安人员每天工作12小时，且未依法支付加班工资或安排补休，那么这种行为将构成违法。
四、加班工资与休息休假的支付规定
对于超出标准工时的工作时间，用人单位应依法支付加班工资或安排补休。按照法律规定，安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的200%的工资报酬；法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的300%的工资报酬。同时，用人单位还应保证劳动者每周至少休息一日。如果用人单位未按照这些规定执行，那么保安12小时制两班倒的工作制度就是违法的。
五、违法后果与应对措施
如果用人单位强制要求保安人员每天工作12小时，且未依法支付加班工资或安排补休，劳动者有权向劳动行政部门投诉，维护自己的合法权益。用人单位则可能面临法律处罚和社会声誉损失等严重后果。因此，用人单位应严格遵守劳动法的规定，合理安排保安人员的工作时间和休息休假。
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