法院判决股权变更协助通知书后，公司法人阻挠执行，权利人可以申请法院强制执行。下面我将对此进行详细分析：

一. 法院判决的效力

1. 法院判决是有法律效力的：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院的判决是有法律效力的，必须履行。如果拒绝执行，法院有权采取很多强制措施，像是冻结银行账户、查封财产等，甚至可能被追究刑事责任。
2. 股权变更协助通知书的作用：法院判决股权变更协助通知书，就是要求公司法人协助办理股权变更手续。这是法院根据案件事实和相关法律作出的决定，必须履行。

二. 公司法人阻挠执行的处理方式

1. 申请强制执行：如果公司法人阻挠执行，权利人可以向法院申请强制执行。法院会依据判决，采取很多强制措施，像是要求公司法人协助办理股权变更，或者对公司进行财务审计、查封财产等，以确保判决得到履行。
2. 可能面临的法律后果：如果公司法人仍然拒绝执行，不仅可能面临上述的强制措施，还可能被追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，拒不执行判决、裁定，情节严重的，是可能构成犯罪的。

三. 实际操作建议

• 与法院沟通：在申请强制执行前，可以先与法院沟通，了解具体的执行程序和需要准备的材料。
• 保留证据：在申请强制执行时，要提供充分的证据证明公司法人阻挠执行的事实，以便法院能够更快地采取措施。

我建议，如果公司法人阻挠执行，不要犹豫，及时向法院申请强制执行，维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。