公司起诉员工所谓“恶意仲裁”的案件，确实是在法院进行，但这一过程涉及仲裁前置程序，且“恶意仲裁”并非法律术语，需具体分析。以下是对您问题的详细解答：

1. 诉讼场所：

   • 当公司认为员工提起的劳动仲裁存在不当或恶意时，若公司选择通过法律途径解决争议，它需要在收到劳动仲裁裁决书后，在法定期限内向基层人民法院提起诉讼。因此，公司起诉员工的案件是在法院进行的。

2. 仲裁前置与通知书：

   • 在劳动争议处理中，仲裁是诉讼的前置程序。这意味着，在大多数情况下，员工需要先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，才能向人民法院提起诉讼。
   • 员工提起劳动仲裁时，会收到仲裁委员会发出的仲裁通知书，这是仲裁程序开始的标志。而公司若认为员工的仲裁请求不当，它需要在收到仲裁裁决书后，根据裁决结果决定是否向法院起诉，此时并不需要额外的“仲裁通知书”来启动诉讼程序。公司起诉的依据是仲裁裁决书及其对裁决结果的不服。

3. “恶意仲裁”的法律分析：

   • “恶意仲裁”并非一个法律上的正式术语。在法律实践中，如果公司认为员工的仲裁请求缺乏事实依据或法律依据，或者存在滥用仲裁程序的情况，公司可以在诉讼中提出相关抗辩，但需要提供充分的证据来支持其主张。
   • 法院在审理此类案件时，会综合考虑双方提供的证据和法律规定，作出公正的裁决。如果法院认定员工的仲裁请求确实存在不当或恶意，它可能会驳回员工的诉讼请求或调整赔偿金额。

4. 法律建议：

   • 对于公司而言，如果认为员工的仲裁请求不当，应当积极准备证据，在法定期限内向法院提起诉讼，并详细阐述其抗辩理由。
   • 对于员工而言，如果收到公司的起诉状，应当认真对待，及时咨询专业律师，准备应诉材料，以维护自己的合法权益。

总结来说，公司起诉员工所谓“恶意仲裁”的案件是在法院进行的，但这一过程需要遵循仲裁前置程序。员工在提起劳动仲裁时会收到仲裁通知书，而公司起诉的依据是仲裁裁决书及其对裁决结果的不服。在处理此类争议时，双方都应当遵循法律程序，提供充分的证据来支持自己的主张。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。