双包工程需提交的单据主要包括施工合同、结算协议、往来函件、工程款项支付凭证以及相关工程资料等。以下是对这些单据的详细分析：
一. 施工合同及相关文件
施工合同：这是双包工程中最基本的单据，它明确了甲乙双方的权利和义务，包括工程范围、工期、质量标准、合同价款及支付方式等关键条款。根据《中华人民共和国合同法》及相关法律法规，施工合同是双方进行工程结算、争议解决等后续工作的重要依据。
合同备案表：在某些地区，施工合同需要进行备案，备案表是备案过程中的重要单据，它证明了合同已经过相关部门的审核和认可。
二. 结算协议及工程款项支付凭证
结算协议：在工程竣工后，甲乙双方需要就工程价款进行结算，并签订结算协议。结算协议详细列出了工程价款的构成、支付方式及时间等，是双方进行工程款项支付的重要依据。
工程款项支付凭证：这包括预付款支付凭证、进度款支付凭证、结算款支付凭证等。这些凭证证明了甲方已经按照合同约定向乙方支付了相应的工程款项，是双方进行财务结算的重要单据。
三. 往来函件及工程资料
往来函件：在工程施工过程中，甲乙双方可能会就工程进展、质量问题、变更洽商等事项进行书面沟通，这些往来函件记录了双方沟通的过程和结果，是解决争议、明确责任的重要依据。
工程资料：这包括施工图纸、设计交底、竣工图纸、洽商变更单、工程签证单、施工日志、隐蔽工程记录、会议纪要等。这些资料详细记录了工程施工的全过程，是证明工程质量、明确工程范围及工程量等的重要依据。
我建议在双包工程实施过程中，甲乙双方应严格按照合同约定和相关法律法规的要求，及时、完整地提交上述单据，并确保单据的真实性和合法性。这样不仅可以保障双方的合法权益，还有助于工程的顺利进行和圆满完成。如有进一步需要，您可以继续咨询我。