诊所自配牙疼药是否违法，需结合具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 诊所及医生的资质：

   • 若诊所具备合法的医疗机构执业许可证，且医生具备相应的医师执业资格，在其执业范围内进行诊疗活动，包括自配药物用于治疗牙疼，这通常是合法的。因为医生有权根据患者病情开具处方或配制药物，这是其执业行为的一部分。
   • 若诊所或医生未取得合法资质，擅自进行诊疗活动并自配药物，则可能构成非法行医。根据《中华人民共和国刑法》第三百三十六条，未取得医生执业资格的人非法行医，情节严重的，将受到刑事处罚。

2. 药物的合法性与安全性：

   • 诊所自配的药物必须符合国家药品管理法规的要求，确保药物的安全性、有效性和质量可控性。若自配药物未经批准或不符合相关标准，可能构成违法。
   • 根据《中华人民共和国药品管理法》的相关规定，从事药品生产、经营活动需取得相应的药品生产许可证或药品经营许可证。虽然诊所自配药物可能不属于典型的药品生产或经营活动，但仍需确保药物的质量和安全，避免对患者造成损害。

3. 诊疗行为的合规性：

   • 诊所自配药物用于治疗牙疼，需遵循医疗规范和行业规定。医生应详细询问患者病情，进行必要的检查，确保药物配制的合理性和针对性。
   • 若诊所自配药物过程中存在违规行为，如未进行必要的检查、未告知患者药物风险等，可能构成医疗过错或医疗事故，需承担相应的法律责任。

法律建议：

• 对于诊所而言，应确保具备合法的医疗机构执业许可证和医师执业资格，严格遵守国家药品管理法规和医疗规范，确保自配药物的安全性和有效性。
• 对于患者而言，若对诊所自配药物存在疑虑，可要求诊所提供药物的相关证明和说明，或咨询其他专业医生意见。若因诊所自配药物导致损害，可依法追究诊所的法律责任。

可能的法律后果：

• 若诊所自配药物行为违法，可能面临行政处罚，如罚款、吊销执业许可证等。
• 若因诊所自配药物导致患者损害，诊所需承担民事赔偿责任，包括赔偿患者医疗费、误工费、残疾赔偿金等。
• 若情节严重，构成非法行医罪，相关责任人还可能面临刑事处罚。

如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。