针对您提出的“公司之间的往来款需要协议吗”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

一、往来款的性质与协议需求

往来款是企业间或企业与个人在经营过程中产生的资金往来，它可能包含借款、预付款、应付款等多种性质。并非所有往来款都需要签订协议，这主要取决于往来款的具体性质和双方的需求。

1. 借款性质：如果往来款是借款性质，那么从防范法律风险的角度出发，最好签订借款协议。借款协议可以明确借款金额、用途、还款时间、利息等关键内容，一旦发生纠纷，这些协议将成为重要的维权依据。

2. 预付款等其他性质：对于预付款、应付款等其他性质的往来款，一般按照交易事实和商业流程处理，可以凭借业务合同、发票等作为凭证。不过，为了防范潜在纠纷，双方也可以采用书面形式说明款项情况，如签订补充协议或出具书面确认函。

二、无协议往来款的风险

如果公司之间的往来款没有签订协议，可能会面临以下风险：

1. 款项性质难以认定：在缺乏书面协议的情况下，款项的性质（如借款、赠与、投资等）可能难以认定，一旦发生纠纷，双方可能各执一词，难以达成一致。

2. 还款期限、利息等约定不明确：无协议约定还款期限、利息等关键条款，可能导致双方对还款时间、是否支付利息及利率标准等产生分歧。

3. 举证难度增加：在诉讼中，如果缺乏书面协议作为证据，出借方可能需要通过聊天记录、交易凭证等其他证据来证明往来款的性质和相关事实，这可能会增加举证的难度和成本。

三、建议与措施

为了降低往来款的风险，保障双方的权益，我们建议：

1. 根据往来款性质签订协议：对于借款性质的往来款，务必签订借款协议；对于其他性质的往来款，也可以考虑签订补充协议或出具书面确认函。

2. 明确协议内容：协议中应明确往来款的金额、用途、还款时间、利息等关键内容，以及违约责任和争议解决方式等条款。

3. 保留相关证据：即使签订了协议，也应保留好转账记录、发票等与往来款相关的证据，以备不时之需。

综上所述，公司之间的往来款是否需要协议取决于往来款的具体性质和双方的需求。为了防范法律风险、保障双方权益，我们建议根据实际情况签订相应的协议。