农业合作社可以变更法人，但必须遵循法定程序。

首先，根据《中华人民共和国农民专业合作社法》以及《市场主体登记管理条例》的相关规定，农民专业合作社（包括农业合作社）在改变营业登记的主要事项时，应当申请变更登记。这其中就包括了法定代表人的变更。

变更法人所需材料：

1. 《农民专业合作社登记（备案）申请书》：这是申请变更登记的基础文件。

2. 变更登记事项涉及合作社章程修改的，需提交修改章程的决议：因为法定代表人的变更可能涉及到合作社的管理结构和决策机制，所以通常需要修改章程。

3. 修改后的章程或者章程修正案：由新的法定代表人签署，以确认变更后的管理结构和决策机制。

4. 变更事项相关证明文件：对于变更法定代表人，需要提交合作社任免职决议，以证明新的法定代表人已经被合作社正式任命。如果法定代表人更改姓名，还需要提交公安部门出具的证明（除非身份证号码未变，此时只需提交新的身份证件复印件）。

5. 其他可能需要的文件：如法律、行政法规和国务院决定规定合作社变更事项必须报经批准的，还需提交有关的批准文件或者许可证件复印件。

变更法人的法定程序：

1. 召开成员大会或成员代表大会：并作出变更法定代表人的决议。这是确保变更过程合法、合规，并充分保障合作社成员知情权、参与权和表决权的重要步骤。

2. 提交申请材料：将上述所需材料提交给有管辖权的登记机关。

3. 登记机关审查：登记机关会对提交的材料进行审查，确保其齐全、符合法定形式。

4. 作出审查决定或办结：如果申请材料齐全且符合法定形式，登记机关会在规定的时间内（如3个工作日内）作出审查决定或办结变更登记。

注意事项：

• 变更过程必须严格遵循法定程序，确保所有合作社成员的知情权、参与权和表决权得到充分保障。
• 提交的材料必须真实、准确、完整，否则可能导致变更登记被拒绝或撤销。
• 如果变更过程中遇到任何问题或困难，建议及时咨询专业律师或登记机关的工作人员。

综上所述，农业合作社可以变更法人，但必须遵循法定程序并提交相应的申请材料。