迟到一次扣工资是否合法，需分情况讨论，关键在于用人单位规章制度的合法性、扣薪标准的合理性以及是否存在合理免责事由。以下从不同角度为您详细分析：
一、规章制度合法有效
制定程序合法：
- 用人单位必须依法制定规章制度，明确将迟到列为违纪行为，并规定合理的扣薪标准。
- 规章制度的制定需经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，这是规章制度合法性的重要前提。
- 若规章制度未经法定程序制定，如未与职工协商、未公示等，则对劳动者不具有法律约束力，此时扣工资可能不合法。
公示或告知：
- 规章制度制定后，应及时向员工公示或告知，如通过公司公告栏张贴、员工手册发放并要求签字确认等方式。
- 确保员工了解并同意相关规定，避免因此产生纠纷。若员工不知情，用人单位扣工资可能缺乏合法依据。
二、扣薪标准合理
扣罚金额适度：
- 扣罚的金额不能过高，应确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。
- 根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
避免显失公平：
- 即便规章制度合法，但扣工资数额过高，明显不合理，也可能不被法律支持。例如，员工迟到几分钟，却被扣了当月一半工资，这就属于显失公平。
三、无合理免责事由
员工无故迟到：
- 员工无故迟到，且不存在不可抗力等合理免责事由时，用人单位方可在合理范围内扣工资。
存在合理免责事由：
- 员工因不可抗力（如自然灾害、交通堵塞等）或其他合理原因导致迟到，用人单位仍扣工资则属于不合法行为。此时，用人单位应考虑实际情况，避免盲目扣工资。
四、劳动者权益保护
- 沟通协商：若劳动者认为用人单位迟到扣工资的行为不合法，首先应与用人单位进行沟通协商，要求其纠正错误做法。
- 投诉或仲裁：协商不成时，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
举例说明：
- 假设某公司规章制度规定，迟到一次扣10元，且该制度经过民主程序制定并已向员工公示。若员工无故迟到，公司依此扣工资是合法的。
- 反之，若公司规章制度未经民主程序制定或未公示，或扣工资数额过高（如迟到几分钟扣当月一半工资），则扣工资行为可能不合法。
总结与建议：
- 完善规章制度：用人单位应制定完善的规章制度，明确工作时间、迟到扣罚措施等内容，并确保规章制度的制定程序合法、内容合理。
- 合理执行：在执行迟到扣工资时，用人单位应遵循公平、公正的原则，根据迟到情况合理扣款，避免过度处罚影响员工的工作积极性和满意度。
- 员工维权：若员工认为用人单位的迟到扣工资行为不合法，可通过沟通协商、投诉或仲裁等途径维护自己的合法权益。
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