遇到门窗装好但对方以有问题为由不肯付钱的情况，你应当通过验证问题真实性、依据合同条款处理、保留证据、沟通协商、寻求第三方调解或采取法律途径来妥善解决。以下是详细步骤：
一、验证问题真实性
- 现场检查：首先，你应当亲自或委托专业人员到现场对门窗进行检查，确认是否存在对方所提出的问题。
- 拍照记录：对现场情况进行详细拍照记录，以便后续作为证据使用。
二、依据合同条款处理
- 查阅合同：仔细查阅合同中关于验收标准、质量问题处理及付款方式等条款。
- 对比问题：将对方提出的问题与合同中的验收标准进行对比，判断是否属于质量问题。
三、保留证据
- 合同与施工记录：确保你手头有完整的合同文本及施工记录，包括设计图纸、施工日志、验收报告等。
- 沟通记录：保存所有与对方的沟通记录，如电话录音、短信、微信聊天记录等。
四、沟通协商
- 理性沟通：与对方进行理性沟通，了解其不肯付款的具体原因及诉求。
- 提出解决方案：如果确实存在问题，可提出合理的解决方案，如维修、更换或给予一定折扣等。
五、寻求第三方调解
- 行业调解：可向当地门窗行业协会或消费者协会申请调解，利用其中立地位寻求双方都能接受的解决方案。
六、采取法律途径
- 发送律师函：若协商无果，可考虑委托律师起草并发送律师函，明确告知对方其行为已构成违约及可能面临的法律后果。
- 提起诉讼：若上述方法均无效，可向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求对方支付款项并承担违约责任。在诉讼过程中，你需提交充分证据证明合同关系、欠款事实及对方的无理拒付行为。
七、预防未来风险
- 完善合同条款：为预防类似情况再次发生，建议在未来的合同中更加详细地规定验收标准、质量问题处理机制及违约责任等条款。
综上所述，我建议你首先验证问题的真实性，然后依据合同条款进行处理，并保留好相关证据。在沟通协商无果的情况下，可以寻求第三方调解或采取法律途径来维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。