违法建筑的发现、立案及管辖问题，主要依据违法建筑所在区域及性质，由不同的行政主体负责。以下是对这一问题的详细解答：
一、违法建筑的发现
违法建筑的发现途径主要包括：
- 上级交办：上级行政机关可能根据工作安排或群众举报，将违法建筑线索交办给下级行政机关进行调查。
- 其他部门移送：如城市管理、国土资源等部门在巡查或执法过程中发现违法建筑，可能将其移送给具有管辖权的行政机关处理。
- 举报：任何单位或个人发现违法建筑，均可向相关行政机关进行举报。
- 巡查发现：行政机关定期或不定期对辖区进行巡查，发现违法建筑后进行记录并处理。
二、违法建筑的立案
当行政机关接到举报或发现违法建筑后，需按照以下程序进行立案：
- 制作《立案审批表》：详细记录违法建筑的基本情况、发现时间、地点等信息。
- 审批立案：经执法大队分管负责人签署意见后，报局分管领导审批，决定是否立案。
三、违法建筑的管辖
违法建筑的管辖主体根据违法建筑所在区域及性质有所不同：
乡村违法建筑：
- 管辖主体：在乡村村庄内违法占用耕地建房的行为，通常由乡、镇人民政府负责调查、核实及认定工作。
- 法律依据：根据相关法律法规，乡、镇人民政府对辖区内的土地利用和规划具有管理职责，因此有权对乡村违法建筑进行管辖。
城市规划区内违法建筑：
- 管辖主体：在城市规划区内违法占地建设或未按规划许可证建设的行为，由县级以上城乡规划主管部门或自然资源主管部门负责调查处理。
- 法律依据：根据《城乡规划法》等相关法律法规，县级以上城乡规划主管部门或自然资源主管部门对城市规划区内的建设活动具有规划管理职责，因此有权对城市规划区内的违法建筑进行管辖。
四、法律建议
- 对于违法建筑的所有者或使用者：应自觉遵守相关法律法规，不得擅自占用土地或违反规划进行建设。如发现自己的建筑被误认为违法建筑，应及时向相关行政机关提供合法证明材料，维护自己的合法权益。
- 对于发现违法建筑的单位或个人：应积极向相关行政机关进行举报，并提供详细线索和证据。同时，应配合行政机关的调查工作，不得干扰或阻碍执法活动。
- 对于相关行政机关：应严格按照法律法规规定的程序和权限进行违法建筑的发现、立案和管辖工作。在执法过程中，应保障当事人的合法权益，听取其陈述和申辩，并依法作出行政处罚决定。
如有任何关于违法建筑的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。