书记员与单位签订合同和与人力资源局签订合同的主要区别，可以从合同性质、合同主体、合同目的、合同期限以及适用的法律等多个方面来详细阐述。
一、合同性质
与单位签订合同：
- 通常为劳动合同或聘用合同。劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利义务的协议。聘用合同则多用于事业单位、部分机关单位和群团组织等，与被聘用人员之间签订，用于明确双方关于工作职责的权利义务关系。
与人力资源局签订合同：
- 这种情况较为特殊，一般不是直接与人力资源局签订劳动合同或聘用合同，而是可能通过人力资源局作为中介或管理方，与某个具体的用人单位（如政府机关、事业单位等）建立劳动关系。但严格来说，合同双方仍然是劳动者与用人单位，人力资源局可能在其中扮演协调、管理或监督的角色。不过，若直接理解为与人力资源局签订“合同”，则这种合同可能更偏向于一种服务协议或派遣协议，其性质与劳动合同或聘用合同有所不同。
二、合同主体
与单位签订合同：
- 主体一方是用人单位（如法院、检察院等），另一方是书记员（劳动者）。
与人力资源局签订合同（假设情境）：
- 若理解为与人力资源局直接签订合同，则主体一方是人力资源局（可能作为管理方或中介），另一方是书记员。但如前所述，这种情况在实际操作中较为少见，且合同性质可能有所不同。
三、合同目的
与单位签订合同：
- 目的在于建立稳定的劳动关系，明确书记员的工作职责、权利义务以及薪酬待遇等，以满足用人单位对书记员岗位的需求。
与人力资源局签订合同（假设情境）：
- 若存在此类合同，其目的可能更多在于通过人力资源局进行人员调配、管理或监督，而非直接建立劳动关系。但这种情况下的合同目的会因具体情境而异。
四、合同期限
与单位签订合同：
- 合同期限可能较为灵活，可以是固定期限合同、无固定期限合同或以完成一定工作为期限的合同。对于书记员岗位，可能更倾向于签订固定期限合同或无固定期限合同，以保障工作的连续性和稳定性。
与人力资源局签订合同（假设情境）：
- 合同期限可能因具体协议而异，不一定遵循劳动合同或聘用合同的常规期限规定。
五、适用的法律
与单位签订合同：
- 若为劳动合同，则适用《中华人民共和国劳动合同法》及相关劳动法律法规。
- 若为聘用合同，则适用专门的人事法律规定，如《事业单位人事管理条例》等。
与人力资源局签订合同（假设情境）：
- 适用的法律可能因合同性质而异。若合同更偏向于服务协议或派遣协议，则可能适用民事法律规范进行调整。
总结：书记员与单位签订合同通常是劳动合同或聘用合同，明确双方劳动关系和权利义务；而与人力资源局直接签订合同的情况较为少见，若存在则可能更偏向于服务协议或派遣协议。在实际操作中，书记员更可能是与具体的用人单位（如法院、检察院等）签订劳动合同或聘用合同，以建立稳定的劳动关系。