在行政诉讼中，如果原告拒绝变更其诉讼请求，而法院认为该诉讼请求与案件事实或法律关系不符，处理方式会依据具体的法律规定和案件情况来决定。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律依据与原则
原告的诉讼权利：在行政诉讼中，原告有权根据自己的意愿确定诉讼请求，这是原告的基本诉讼权利。
法院的审理范围：法院的审理应当围绕原告的诉讼请求进行，确保审理的针对性和有效性。
释明义务：如果法院认为原告的诉讼请求与事实不符或法律关系认定有误，有义务向原告释明，询问其是否愿意变更诉讼请求。
二、拒绝变更诉讼请求的处理
尊重原告意愿：如果原告明确表示拒绝变更诉讼请求，法院应当尊重原告的选择，继续审理原告诉请的案件。
审理与判决：
- 法院将基于原告提出的诉讼请求和提供的证据进行审理。
- 如果原告的诉讼请求缺乏事实或法律依据，法院可能会判决驳回原告的诉讼请求。
- 在某些情况下，如果法院认为原告的诉讼请求虽然表述不当，但实质上涉及另一法律关系，且该法律关系与案件有关联，法院可能会向原告释明并建议其变更诉讼请求。若原告仍拒绝，法院可能基于现有证据和法律关系作出判决，但判决范围不会超出原告的原始诉讼请求。
程序公正性：
- 法院在审理过程中应确保程序的公正性，不得擅自变更案由或法律关系，以避免剥夺被告针对新诉讼请求的举证和答辩权利。
- 如果被告认为法院的审理超出了原告的诉讼请求范围，有权提出异议。
三、实际操作建议
原告方面：
- 在提起行政诉讼前，应充分准备证据和法律依据，确保诉讼请求的合理性和合法性。
- 如果法院提出变更诉讼请求的建议，应认真考虑并权衡利弊。
被告方面：
- 密切关注法院的审理范围和原告的诉讼请求，确保自己的诉讼权利不受侵害。
- 如果认为法院的审理超出了原告的诉讼请求范围，应及时提出异议并进行辩护。
四、特殊情况处理
- 如果原告错列被告且拒绝变更，根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第二十六条，法院应裁定驳回起诉。但这一规定主要针对被告不适格的情况，与诉讼请求的变更不完全相同。不过，它体现了法院在原告拒绝合理变更时的处理原则。
综上所述，当行政诉讼中的原告拒绝变更诉讼请求时，法院应在尊重原告意愿的基础上，依法审理案件，并确保程序的公正性。同时，原被告双方都应积极行使自己的诉讼权利，以维护自身的合法权益。