公司检查员工包包是不合法的，该行为侵犯了员工的隐私权。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律角度

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人的人身自由、人格尊严受法律保护，而隐私权正是人格尊严的重要组成部分。员工的个人物品，包括包包，均属于其私人空间的一部分，公司无权随意搜查或检查。因此，公司未经员工同意擅自检查其包包，属于违法行为。

二、法律后果

若公司未经员工同意擅自检查其包包，将可能承担相应的法律后果。根据《治安管理处罚法》的相关规定，偷窥、偷拍、窃听、散布他人隐私的行为，将受到法律的制裁，包括处五日以下拘留或者五百元以下罚款；情节较重的，处五日以上十日以下拘留，并可以并处五百元以下罚款。虽然此条款主要针对的是个人行为，但公司若以组织名义实施类似行为，同样可能被视为对员工隐私权的严重侵犯，并可能面临更严重的法律后果，包括但不限于民事赔偿、行政处罚乃至刑事责任。

三、员工隐私权保护措施

为了有效保护员工的隐私权，可以采取以下措施：

1. 法律宣传与教育：加强员工对隐私权保护的法律意识，通过培训、讲座等形式，让员工了解隐私权的重要性及其法律保护机制。
2. 明确公司政策：制定并公布明确的公司政策，明确规定公司不得随意搜查或检查员工的个人物品，包括包包等，确保员工隐私权在公司内部得到尊重和保护。
3. 建立投诉机制：设立专门的投诉渠道，鼓励员工在隐私权受到侵犯时及时向公司反映情况，并确保投诉能够得到及时、公正的处理。
4. 强化内部管理：加强公司内部管理，防止个别管理人员或员工利用职务之便侵犯他人隐私权。对于违反公司政策、侵犯员工隐私权的行为，应依法依规严肃处理。
5. 倡导尊重隐私的企业文化：通过企业文化建设，倡导尊重隐私、保护隐私的价值观，营造和谐、健康的工作环境。

建议：作为员工，如果遇到公司未经同意检查包包的情况，可以勇敢地站出来维护自己的合法权益。可以向公司管理层反映情况，要求停止侵权行为；如果公司不予理会或处理不当，还可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。作为公司，也应该尊重员工的隐私权，避免采取侵犯员工隐私的行为，以免引发法律纠纷和不良影响。

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