扣押对方营业执照是违法的。

首先，从法律角度来看，营业执照是企业或个体工商户合法经营的凭证，受到法律的保护。任何单位或个人都无权擅自扣押或留存他人的营业执照。如果你因为对方未支付款项而扣押其营业执照，这构成了对他人财产权的侵犯，是违法的行为。

其次，如果你与对方存在经济纠纷，应该通过合法的途径来解决，比如协商、调解、仲裁或诉讼等。扣押营业执照不仅不能解决问题，反而可能激化矛盾，甚至导致更严重的法律后果。

因此，我建议你立即归还对方的营业执照，并通过合法的途径来解决你们之间的经济纠纷。如果你需要法律上的帮助或建议，可以随时向我咨询，我在交通事故和税务纠纷领域有着丰富的经验，可以为你提供专业的指导。