市委招商引资指挥部交办函的法律效力，需结合其性质、内容及具体情境综合判断，但总体而言，其法律效力取决于发函主体的权限及函件内容的合法性。以下从不同角度为您详细分析：

1. 交办函的法律性质

• 行政指导性质：若交办函属于行政指导行为（如建议、协调、督促等），其法律效力主要体现在对行政相对人的引导或建议上，不直接产生强制力。但若相对人因信赖该指导而采取行动，可能因行政指导的瑕疵（如违法、错误）主张赔偿。
• 具体行政行为性质：若交办函包含具体要求（如限期办理某事项、停止某行为等），且发函主体具有法定权限，则可能构成具体行政行为，具有强制执行力。此时，相对人若不履行，可能面临行政处罚或强制执行。

2. 发函主体的权限

• 法定权限：市委招商引资指挥部若经法律、法规或规章授权，具备相应管理权限，则其交办函具有法律效力。例如，若指挥部依据《地方各级人民政府机构设置和编制管理条例》等法规设立，并明确其职责范围，则其发函行为合法。
• 越权发函：若指挥部超越法定权限发函（如要求企业承担非其管辖范围内的义务），则该函件可能因越权而无效。此时，相对人可主张函件无效，并拒绝履行。

3. 函件内容的合法性

• 内容合法：若交办函内容符合法律、法规规定（如要求企业遵守环保标准、履行合同义务等），则具有法律效力。相对人若违反，可能承担法律责任。
• 内容违法：若函件内容违反法律、法规（如要求企业违法排污、逃避税收等），则该函件无效。相对人不仅可拒绝履行，还可向有关部门举报发函主体的违法行为。

4. 相对人的权利与义务

• 权利：相对人有权要求发函主体出示法定依据，若无法提供或依据不足，可拒绝履行函件要求。同时，相对人可就函件内容提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼。
• 义务：若函件内容合法且发函主体具有权限，相对人应履行函件要求。否则，可能面临行政处罚或强制执行。

5. 实务建议

• 核实发函主体权限：收到交办函后，首先核实指挥部是否具备法定权限，可通过查询相关法规、规章或咨询政府部门确认。
• 审查函件内容合法性：仔细审查函件内容是否符合法律、法规规定，若存在疑问，可咨询专业律师或向有关部门申请合法性审查。
• 及时沟通与反馈：若对函件内容有异议，应及时与发函主体沟通，说明理由并提交相关证据。必要时，可申请行政复议或提起行政诉讼。

总结：市委招商引资指挥部交办函的法律效力需结合其性质、发函主体权限及函件内容合法性综合判断。若您收到此类函件，建议先核实发函主体权限及函件内容合法性，再决定是否履行。如有疑问，可直接向我咨询，我将为您提供专业法律意见。