物流公司是否有权扣工资，需视具体情况而定，无法一概而论地说有权或无权。以下从不同角度进行分析：
合法扣工资的情形
员工过错导致公司损失：
- 若员工因个人行为（如疏忽、违规操作等）给公司造成了经济损失，公司有权依据劳动合同或公司规章制度，要求员工承担相应的赔偿责任。
- 但扣除金额有限制：每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。例如，若员工当月工资为5000元，公司最多可扣除1000元作为赔偿，且扣除后员工工资不得低于当地最低工资。
法定扣款情形：
- 根据相关法律法规，如个人所得税、社会保险费、住房公积金等法定扣款项目，公司有权从员工工资中扣除相应金额。
- 这些扣款是员工的法定义务，公司只是代为扣缴，不属于公司擅自扣工资的行为。
非法扣工资的情形
无合法依据扣款：
- 若公司无法提供合法的扣款依据（如劳动合同约定、公司规章制度等），或扣款名目不合理（如虚构的罚款、未达到不合理工作指标等），则属于非法扣款。
- 例如，公司以“员工未完成不切实际的任务量”为由扣款，且该任务量明显超出员工正常工作能力范围，这种扣款就是非法的。
扣款程序不合法：
- 即使公司有合法的扣款依据，但若未按照法定程序进行（如未提前告知员工、未经过民主程序制定规章制度等），也可能构成非法扣款。
- 例如，公司未在劳动合同中明确约定扣款条款，也未在员工手册等规章制度中规定扣款事项，却擅自扣款，这种行为就是违法的。
员工应对非法扣工资的措施
与公司协商：
- 若员工认为公司扣款行为不合法，首先应尝试与公司进行协商，要求公司说明扣款依据和程序，并协商解决扣款问题。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理非法扣款行为。
申请劳动仲裁：
- 若对劳动监察部门的处理结果不满意，或公司拒绝接受劳动监察部门的调查和处理，员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结来看，物流公司是否有权扣工资，取决于扣款行为是否具备合法理由及程序。若扣款行为合法合规，则公司有权扣款；若扣款行为无法律依据或程序不合法，则属于非法扣款，员工有权通过法律途径维护自己的权益。若您遇到物流公司非法扣工资的情况，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。