农村分家协议超过了三年，女儿仍然有权参与分家，但具体能否分得财产以及分得多少，需结合分家协议的性质、内容以及相关法律规定来综合判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、分家协议的性质与效力
分家协议，本质上是一种家庭内部的财产分配协议，其效力主要取决于协议的内容是否合法、是否体现了各方当事人的真实意愿，以及是否违反了法律的强制性规定。如果分家协议是合法有效的，那么它对于协议各方都具有约束力。然而，分家协议并不等同于法律上的财产分割或继承，其效力范围及持续时间需根据协议具体内容及法律规定来判断。
二、女儿参与分家的法律依据
法定继承权：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，子女作为第一顺序继承人，在父母去世后享有法定继承权。虽然分家协议可能涉及父母在世时的财产分配，但女儿作为家庭成员，其合法权益应得到保障。如果分家协议未明确排除女儿的权益，或者协议内容违反了法律的强制性规定（如剥夺了女儿的合法继承权），那么女儿仍有权要求重新分配或确认其权益。
协议内容与公平原则：即使分家协议已经签订多年，如果协议内容存在显失公平、欺诈、胁迫等情形，或者协议未充分考虑女儿的合法权益，女儿仍有权在合理期限内提出异议或要求重新分配。这里的“合理期限”并非固定不变，而是需根据具体情况（如协议内容、女儿知晓协议的时间、是否曾提出异议等）来判断。
三、女儿参与分家的实际操作建议
审查分家协议：首先，女儿应仔细审查分家协议的内容，确认协议是否明确排除了她的权益，以及协议是否违反了法律的强制性规定。
与家庭成员协商：如果女儿认为自己在分家协议中的权益受到了侵害，可以尝试与家庭成员进行协商，寻求达成新的分配方案或确认原有协议的公平性。
寻求法律帮助：如果协商无果，女儿可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径来维护自己的合法权益。律师可以根据具体情况，为女儿提供法律咨询、代理诉讼等服务。
四、可能的法律后果
如果分家协议合法有效且未违反公平原则：女儿可能难以直接推翻原有协议，但可以通过协商或法律途径来寻求合理的解决方案。
如果分家协议存在违法或显失公平的情形：女儿有权要求重新分配或确认其权益，甚至可能通过诉讼来推翻原有协议。
建议：农村分家协议超过了三年，女儿仍然有权关注自己的合法权益。如果认为自己在分家协议中的权益受到了侵害，可以积极与家庭成员协商或寻求法律帮助。有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。