关于离职证明由谁存入档案的问题，这通常取决于您离职后的档案保管情况以及原单位或新接收档案单位的具体规定。不过，我可以根据一般情况和相关政策，给您一个较为全面的解答。

首先，离职证明是员工离职时由原单位出具的一份证明文件，它记录了员工的离职时间、离职原因等关键信息，对于员工后续的就业、社保转移等事项都具有重要作用。

在档案保管方面，如果您是机关事业单位的辞职、辞退人员，根据一些地方性的政策文件（如您提供的参考信息中的《中共云南省委组织部省人力资源和社会保障厅等五部门关于转发进一步加强流动人员人事档案管理服务工作文件的通知》等），您的档案管理手续通常由原单位经办人到相应的人才服务中心办理。在这个过程中，离职证明作为档案材料的一部分，很可能会由原单位经办人一并存入您的个人档案中。

如果您离职后档案需要转移到新的接收单位（如新公司、人才市场等），那么离职证明的存入方式可能会有所不同。一般来说，新接收档案单位在接收您的档案时，会要求您提供包括离职证明在内的相关材料。在这种情况下，您可能需要自己将离职证明交给新接收档案单位，由他们负责存入您的档案中。

另外，还有一些特殊情况需要注意。比如，如果您离职后选择自主创业或成为自由职业者，且没有明确的档案接收单位，那么您的档案可能会暂时存放在户籍所在地的人才服务中心或公共就业服务机构。在这种情况下，您可能需要自己将离职证明等材料交给这些机构，由他们负责存入您的档案中。

总的来说，离职证明由谁存入档案并没有一个固定的答案，它取决于您离职后的档案保管情况以及相关单位的具体规定。为了确保离职证明能够正确存入您的档案中，我建议您在离职时与原单位人事部门或新接收档案单位进行沟通确认，了解他们的具体要求和流程。

希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。