国有股权两次拍卖失败后，是可以考虑协议转让的。但这一操作需要遵循相关法律法规和监管规定，确保转让的合法、合规、公正。

具体来说，国有股权的转让，包括协议转让，通常需要经过履行出资人职责的机构批准。在两次拍卖失败后，若选择协议转让，转让方应当如实披露有关信息，征集受让方，并可能需要采取公开征集或其他公开方式来确定受让方。此外，对于不同类型的国有股权，其协议转让的具体要求和程序可能会有所差异。

因此，在进行国有股权协议转让时，建议转让方和受让方都充分了解相关法律法规和监管要求，并咨询专业律师或相关机构的意见，以确保转让过程的合法性和合规性。同时，也需要注意转让过程中的风险防控，避免可能出现的法律纠纷和风险。

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