船长不在船上时，其安全责任与义务主要通过其指定的代理人或船上其他高级船员来承担。以下是对这一问题的详细分析：
一. 船长不在船上的情况说明
船长作为船上的最高指挥者，是船舶安全的第一责任人。然而，在某些情况下，船长可能因故不在船上，如休假、疾病或其他个人原因。
二. 船长不在船上的安全责任与义务承担
指定代理人
- 根据新《海上交通安全法》第四十一条，船长在航行中死亡或者因故不能履行职责的，应当由驾驶员中职务最高的人代理船长职务。通常情况下，大副被视为驾驶员中职务最高的人，负责代理船长履行安全责任与义务。
船上高级船员的责任
- 即使船长不在船上，船上其他高级船员（如大副、二副等）也有责任确保船舶的安全航行。他们应遵守船长的指示和船舶的安全管理制度，确保船舶适航、船员适任、货物适载，并随时准备应对紧急情况。
三. 船长对船舶安全的持续监督
- 尽管船长可能不在船上，但他们仍应通过远程通信手段或其他方式保持对船舶安全状况的了解，并在必要时提供指导和支持。船长还应确保船舶的安全管理体系得到有效执行，并对任何可能影响船舶安全的问题及时作出反应。
四. 船长不在船上的法律责任
- 如果船长因故不在船上，且未能指定合适的代理人或未能确保船舶的安全管理体系得到有效执行，导致船舶发生安全事故，船长仍可能承担相应的法律责任。因此，船长在离开船舶前应确保所有安全措施已得到妥善安排。
我的建议：
- 船长在离开船舶前应制定详细的安全管理计划，明确指定代理人和其他高级船员的安全责任与义务。
- 船长应保持与船舶的通信联系，确保随时了解船舶的安全状况，并在必要时提供指导和支持。
- 船长应定期对船舶的安全管理体系进行审查和改进，以确保其持续有效。
如有进一步需要，您可以继续咨询我。