当货车发生撞死人的交通亡人事故时，交通运输部门（通常与应急管理部门等相关机构协同工作）会根据事故的性质、严重程度以及企业在安全生产方面的责任，对企业进行相应的处罚。以下是对此问题的详细解答：

一、对生产经营单位的处罚

根据《中华人民共和国安全生产法》的相关规定，一旦发生生产安全事故，对负有责任的生产经营单位，除要求其依法承担相应的赔偿等责任外，应急管理部门还会依照事故等级处以罚款：

1. 一般事故：处三十万元以上一百万元以下的罚款。
2. 较大事故：处一百万元以上二百万元以下的罚款。例如，在沈海高速厦门翔安段的事故中，某货运企业因负有责任被处以125万元的行政处罚。
3. 重大事故：处二百万元以上一千万元以下的罚款。
4. 特别重大事故：处一千万元以上二千万元以下的罚款。若事故情节特别严重、影响特别恶劣，罚款数额还可以是前款规定的二倍以上五倍以下。

二、对生产经营单位主要负责人的处罚

生产经营单位的主要负责人若未履行安全生产管理职责，导致发生生产安全事故，同样会受到处罚：

1. 一般事故：处上一年年收入百分之四十的罚款。
2. 较大事故：处上一年年收入百分之六十的罚款。在沈海高速厦门翔安段的事故中，货运企业主要负责人就因此被处以上一年年收入百分之六十的行政处罚。
3. 重大事故：处上一年年收入百分之八十的罚款。
4. 特别重大事故：处上一年年收入百分之一百的罚款。

三、其他可能的处罚措施

除了罚款外，交通运输部门还可能采取以下措施：

1. 约谈企业负责人和安管人员：通过“警示普法”、“以案释法”等方式，向其阐述企业不履行安全生产主体责任将面临的严重后果。
2. 下达责令整改通知书：要求企业限期整改到位，消除安全隐患。
3. 立案处罚：对未落实安全生产主体责任的企业进行立案处罚，如红古区交通局对某货运企业的处罚案例。

四、建议与倡导

为了避免类似事故的发生，各生产经营单位及其主要负责人、司机朋友们应自觉学习《中华人民共和国安全生产法》、《中华人民共和国刑法》、《中华人民共和国民法典》等法律知识，规范管理，安全出行。同时，交通运输部门也应加强道路货物运输安全监管，全面筑牢道路货物运输领域安全防线。

综上所述，当货车发生撞死人的交通亡人事故时，交通运输部门会根据事故等级和企业在安全生产方面的责任，对企业及其主要负责人进行相应的处罚，并可能采取其他措施以确保道路交通安全。