土地使用权及地上在建工程可以分开出资到项目公司中，但需满足一定条件并遵循相关法律规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律可行性

1. 土地使用权出资：

   • 根据《公司法》及相关规定，股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资。因此，土地使用权作为非货币财产，在符合相关条件（如权属清晰、无争议、可依法转让等）的前提下，是可以作为出资方式之一投入到项目公司中的。

2. 地上在建工程出资：

   • 地上在建工程，作为建筑物的一部分或全部，在符合相关条件（如已完成一定比例的建设、权属清晰、无争议等）时，同样可以视为一种可估价的财产进行出资。然而，需要注意的是，在建工程的出资可能涉及更多的法律和实务问题，如建设工程的合法性、是否已完成相关审批手续、是否存在抵押或查封等权利限制等。

二、实务操作要点

1. 评估与作价：

   • 无论是土地使用权还是地上在建工程，作为出资时都需要进行准确的评估和作价。这通常需要由专业的评估机构进行，以确保出资财产的价值与项目公司的注册资本或股本相匹配。

2. 权属转移与登记：

   • 出资后，土地使用权和地上在建工程的权属需要依法转移到项目公司名下。这通常涉及土地使用权的变更登记和建筑物的产权登记等手续。

3. 合规性审查：

   • 在出资前，需要对土地使用权和地上在建工程的合规性进行审查。这包括但不限于审查土地使用权的取得方式是否合法、是否存在权属争议、地上在建工程是否已完成相关审批手续等。

三、潜在风险与防范

1. 权属风险：

   • 如果土地使用权或地上在建工程存在权属争议或权利限制（如抵押、查封等），则可能导致出资无效或引发法律纠纷。因此，在出资前需要进行充分的尽职调查。

2. 价值评估风险：

   • 如果评估机构对土地使用权或地上在建工程的评估价值不准确，可能导致出资财产的价值与项目公司的注册资本或股本不匹配，从而引发法律风险。因此，需要选择有资质的评估机构进行评估。

3. 法律合规风险：

   • 在出资过程中，需要遵守相关法律法规和政策规定。如果违反相关规定，可能导致出资无效或受到行政处罚等法律后果。因此，建议在出资前咨询专业律师或法律机构进行合规性审查。

建议：在将土地使用权及地上在建工程分开出资到项目公司中时，务必进行充分的尽职调查、评估作价和合规性审查。同时，建议咨询专业律师或法律机构以获取更具体的法律建议和指导。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律服务。