劳动者违反保密条款，用人单位可依法追究其民事责任、行政责任乃至刑事责任，并可考虑解除劳动合同。以下从不同角度为您详细分析：
一、民事责任
支付违约金：
- 若保密协议中明确约定了违约金，劳动者违反保密条款时，需按约定支付违约金。例如，某公司与员工约定违反保密协议需支付10万元违约金，员工离职后泄露商业秘密，公司即可依据协议要求其支付此金额。
赔偿损失：
- 劳动者违反保密协议给用人单位造成实际损失的，需赔偿全部损失，包括直接损失（如研发成本、客户流失导致的收入减少）和间接损失（如未来预期利益的丧失）。例如，科技公司员工泄露新技术导致公司损失150万元，公司可要求其全额赔偿。
二、行政责任
- 若劳动者泄露的是涉及国家秘密或构成不正当竞争的商业秘密，用人单位可向工商行政管理部门举报。依据《中华人民共和国反不正当竞争法》的相关规定，工商行政管理部门有权依法责令停止违法行为，并可根据情节处以一万元以上、二十万元以下的罚款。同时，还可责令侵权人将载有商业秘密的图纸、软件及其他有关资料返还权利人或销毁。
三、刑事责任
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，劳动者侵犯商业秘密且给用人单位造成重大损失（通常指经济损失50万元以上）的，可能面临三年以下有期徒刑、拘役及罚金；造成特别严重后果的，则处三年以上七年以下有期徒刑并处罚金。例如，制药公司员工窃取并出售新药配方，造成80万元损失，即构成侵犯商业秘密罪。
四、合同解除
- 严重违反保密协议的行为可视为严重违纪，用人单位有权依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定解除劳动合同。例如，员工在保密协议中明确承诺不泄露公司核心技术，但离职后立即将技术出售给竞争对手，导致公司遭受重大损失，此时公司可依法解除与其的劳动合同。
五、其他建议
协商解决：
- 发现劳动者违反保密协议后，用人单位可先与其沟通，指出违约行为，要求停止侵权、消除影响，并按协议约定承担违约责任（如支付违约金）。协商解决能避免矛盾激化，维持双方关系。
法律措施：
- 若协商无果，用人单位可采取仲裁或诉讼手段。若保密协议中有仲裁条款，应向约定的仲裁机构申请仲裁；若没有仲裁条款，则可向法院提起诉讼，请求法院判决劳动者承担违约责任、赔偿损失。
加强保密管理：
- 为预防类似事件再次发生，用人单位应加强员工保密意识培训，完善保密管理制度，如设置保密等级、限制访问权限、签订保密承诺书等。
总结来看，劳动者违反保密条款时，用人单位应综合考虑具体情况，采取适当的法律措施和经济手段来维护自身权益。同时，加强保密管理也是预防此类事件发生的关键。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。