当建设单位意见与设计不符时，可以按照以下步骤处理：

一、明确不符内容与性质

首先，需要详细对比建设单位的意见与原始设计文件，明确哪些部分存在不符，并判断这种不符是技术性调整、设计错误修正，还是对原设计方案的重大变更。这一步骤至关重要，因为它决定了后续处理的法律路径和策略。

• 技术性调整：如果建设单位的意见仅涉及设计细节的微调，且不影响整体设计方案的实施和安全性，那么这种调整可能属于正常的施工过程中的技术沟通范畴。
• 设计错误修正：若建设单位指出设计文件中存在错误或遗漏，并要求修正，这通常需要设计单位重新审核并出具修正后的设计文件。
• 重大设计变更：如果建设单位的意见涉及对原设计方案的重大修改，如改变建筑结构、使用功能等，这可能构成对原合同的实质性变更，需要按照合同约定的变更程序进行处理。

二、依据合同条款处理

1. 审查合同条款：仔细审查施工合同中关于设计变更、意见分歧解决的条款。合同中通常会规定设计变更的程序、责任划分以及争议解决方式。

2. 协商与沟通：

   • 初步沟通：与建设单位进行初步沟通，了解其提出不符意见的具体原因和依据。
   • 协商解决：在明确不符内容与性质的基础上，尝试与建设单位协商达成一致。协商过程中，可以邀请设计单位参与，共同探讨解决方案。

3. 履行合同变更程序：如果协商达成一致，且涉及设计变更，应按照合同约定的变更程序进行。这通常包括提交变更申请、审核变更内容、签订变更协议等步骤。

三、法律途径解决争议

如果与建设单位无法通过协商达成一致，且合同中未规定有效的争议解决方式，或者规定的争议解决方式无法有效解决问题，可以考虑通过法律途径解决争议。

1. 发送律师函：在正式提起诉讼或仲裁前，可以委托律师向建设单位发送律师函，明确表达己方的立场和要求，并给予建设单位一定的期限进行回应或修正。

2. 提起诉讼或仲裁：

   • 诉讼：如果建设单位在收到律师函后仍未作出积极回应或修正，可以向人民法院提起诉讼，要求建设单位承担违约责任或赔偿损失。
   • 仲裁：如果合同中约定了仲裁条款，且双方均同意通过仲裁方式解决争议，可以向约定的仲裁机构申请仲裁。

四、预防措施与建议

1. 完善合同条款：在签订施工合同时，应尽可能详细、明确地约定设计变更的程序、责任划分以及争议解决方式，以减少后续争议的发生。

2. 加强沟通与协调：在施工过程中，应加强与建设单位、设计单位的沟通与协调，及时发现并解决问题，避免问题积累导致重大争议。

3. 保留证据：在处理设计不符问题的过程中，应妥善保留相关证据，如沟通记录、会议纪要、设计文件等，以备后续争议解决之需。

总结：当建设单位意见与设计不符时，应首先明确不符内容与性质，然后依据合同条款进行处理。如果无法通过协商达成一致，可以考虑通过法律途径解决争议。同时，为了预防类似问题的发生，应完善合同条款、加强沟通与协调，并妥善保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。