借款合同上加盖有公司章和法人章，并且有转账凭证，这样的证据在一般情况下是有效的。以下从不同角度进行详细分析：
一、公司章和法人章的法律效力
公司章的法律效力：
- 公司章是公司对外行使权利、承担义务的重要凭证。在借款合同上加盖公司章，通常意味着公司认可该借款合同的内容，并愿意承担相应的法律责任。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。因此，公司章在借款合同上的加盖，是合同成立的重要要素之一。
法人章的法律效力：
- 法人章代表公司的法定代表人，即法人的意志。在借款合同上加盖法人章，可以视为法定代表人对借款合同的确认和授权。
- 法定代表人以法人名义从事的民事活动，其法律后果由法人承受。因此，法人章在借款合同上的加盖，也增强了合同的有效性和执行力。
二、转账凭证的法律效力
- 转账凭证是证明资金实际交付的重要证据。在民间借贷中，资金的交付是借款合同生效的关键要件之一。
- 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，出借人向人民法院提起民间借贷诉讼时，应当提供借据、收据、欠条等债权凭证以及其他能够证明借贷法律关系存在的证据。转账凭证作为资金交付的直接证据，对于证明借贷关系的存在和借款的实际发生具有重要作用。
三、综合判断
合同有效性：
- 借款合同上加盖有公司章和法人章，表明公司对借款合同的认可和授权。同时，转账凭证证明了资金的实际交付。因此，在一般情况下，这样的借款合同是有效的。
可能存在的风险：
- 尽管公司章和法人章以及转账凭证增强了借款合同的有效性，但仍需注意合同内容是否合法、合规。例如，借款利率是否超过法定上限、借款用途是否合法等。
- 此外，还需关注公司章和法人章的真实性。如果章是伪造的或者被盗用的，那么借款合同可能面临无效的风险。因此，在签订借款合同时，应确保章的真实性和合法性。
法律建议：
- 在签订借款合同时，除了加盖公司章和法人章以及保留转账凭证外，还应确保合同内容明确、具体，并符合相关法律法规的规定。
- 如果对借款合同的效力或内容存在疑虑，建议及时咨询专业律师进行审查和指导。
有问题可以直接向我咨询，作为专业律师，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。