结论前置：发票是否可以不经过甲方同意作废，需分情况讨论，具体如下：

1. 增值税专用发票的作废规则
   根据《增值税专用发票使用规定》，已开具的增值税专用发票若需作废，必须同时满足以下条件：

   • 收到退回的发票联、抵扣联时间未超过销售方开票当月；
     
   • 销售方未抄税且未记账；
     
   • 购买方未认证或认证结果为“纳税人识别号认证不符”“专用发票代码、号码认证不符”。
     关键点：若发票已由甲方（购买方）认证，则销售方（乙方）无权单方作废，必须通过开具红字发票处理。此时若未经甲方同意，乙方擅自作废可能构成违规，导致甲方无法抵扣税款，甚至引发税务风险。

2. 普通发票的作废规则
   普通发票的作废条件相对宽松，但需遵循《发票管理办法》中“不得虚开发票”的原则。若发票已交付甲方且无错误（如开票信息错误、商品服务变更等合理事由），销售方无权单方作废。若未经甲方同意强行作废，可能被认定为“未按规定开具发票”，面临税务机关处罚，同时需承担对甲方的违约责任（如重新开具发票、赔偿损失等）。

3. 合同约定优先
   若双方在合同中明确约定了发票作废的条件（如“经双方书面确认后方可作废”），则必须遵守合同条款。未经甲方同意作废发票，可能构成违约，甲方有权要求乙方继续履行合同义务（如重新开具合规发票）或赔偿损失。

实务建议：

• 销售方若需作废发票，应第一时间与甲方沟通，说明作废原因（如开票信息错误），并取得甲方书面同意；
  
• 若甲方拒绝配合，销售方可通过法律途径解决（如诉讼或仲裁），但需承担时间成本和诉讼风险；
  
• 甲方若发现销售方擅自作废发票，可向税务机关举报，并要求销售方承担违约责任。
  

如有具体案例或合同条款需分析，可直接向我提问。