清理公共区域的花盆是否违法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
不涉及违法的情况
- 合法清理：如果公共区域的花盆是未经许可放置的，或者已经对公共安全、公共秩序造成了影响，且清理行为得到了相关管理部门或公共区域所有者、管理者的明确许可，那么这种清理行为是合法的。例如，小区物业为了维护公共区域的整洁和安全，对违规放置的花盆进行清理。
可能涉及违法的情况
侵犯物权：
- 公共区域的物权可能归属于特定主体或全体业主共有。如果清理的花盆是他人合法放置的，且清理行为未经物权所有者或管理者的同意，那么这种清理行为可能构成对物权的侵犯。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，物权受法律保护，任何组织或个人不得侵犯。因此，未经允许清理他人花盆，物权所有者或管理者有权要求停止侵害并恢复原状，甚至可能要求赔偿损失。
违反城市管理规定：
- 各地有城市容貌管理的相关规定，如果清理行为违反了这些规定，也可能构成违法。例如，某些城市可能规定公共区域不得随意堆放物品，包括花盆。如果未经许可清理花盆，且清理过程中造成了公共区域的破坏或影响了市容市貌，那么这种行为可能违反城市管理规定，面临相应的处罚。
违反程序规定：
- 即使清理行为本身是出于公共利益，但如果未遵循相应的程序规定，也可能构成违法。例如，在清理前未进行公告或通知，导致花盆所有者不知情；或者在清理过程中未采取合理的措施保护花盆所有者的财产权益，导致损失扩大。这些行为都可能因违反程序规定而面临法律责任。
综合建议
- 了解规定：在清理公共区域的花盆前，务必了解并遵守相关法律法规及管理规定，确保行为合法合规。
- 获得许可：如果可能涉及侵犯物权或违反城市管理规定的情况，应事先向相关部门或管理者申请并获得许可。
- 合理程序：在清理过程中，应遵循合理的程序，如公告、通知等，确保花盆所有者的知情权，并采取合理的措施保护其财产权益。
- 协商解决：如果与花盆所有者存在争议，应优先通过协商解决，避免矛盾升级。
如果您在清理公共区域花盆的过程中遇到法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。