针对您提出的“工伤认定书下来之前按自费结算了，是否可以再拿着认定书去医院退费”的问题，这主要取决于当地医院及工伤保险政策的具体实施情况。不过，我可以根据一些已知的信息和政策导向，给您一个较为详细的解答。

首先，从政策层面来看，《工伤保险条例》明确规定，职工在签订服务协议的医疗机构治疗工伤，符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的相关费用，应从工伤保险基金支付。这意味着，如果您的治疗费用符合这些规定，理论上应该由工伤保险基金来承担。

接下来，关于退费的具体操作，这通常与当地医院和工伤保险部门的合作机制有关。以南通市为例，该市已经启动了工伤医疗自费转结算试点工作。在这个试点中，工伤职工在拿到工伤认定决定书后，到试点医院刷社保卡就诊时，之前垫付的医疗费用中可以由工伤保险基金报销的部分会退回原账户。这大大简化了退费流程，减轻了工伤职工的经济压力。

然而，并非所有地区都实施了这样的试点政策。如果您的地区没有类似的自费转结算机制，那么您可能需要按照传统的报销流程来操作。这通常包括：收集所有相关的医疗费用单据、工伤认定决定书以及其他可能需要的证明材料，然后到当地的人社部门或工伤保险经办机构进行报销申请。

至于您提到的“拿着认定书去医院退费”，这主要取决于医院是否具备直接处理工伤保险报销的能力。如果医院与工伤保险部门有紧密的合作，并且医院系统支持相关结算工作，那么您有可能在医院直接办理退费。但如果医院没有这样的能力，您可能还是需要到人社部门或工伤保险经办机构去办理报销手续。

总的来说，我建议您先了解当地医院和工伤保险部门的具体政策，以及他们之间的合作机制。如果可能的话，您可以咨询医院的相关部门或拨打工伤保险部门的咨询电话，以获取最准确和最新的信息。这样，您就可以根据具体情况来决定如何操作退费事宜了。