在法庭审理中，被告自认的事实，原则上会被法院直接作为认定案件事实的依据，但存在例外情形。具体处理方式如下：

1. 自认事实的直接效力
   根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第三条，在诉讼过程中，一方当事人陈述的于己不利的事实，或者对于己不利的事实明确表示承认的，另一方当事人无需举证证明。这意味着，被告一旦作出自认，法院通常会直接采纳该事实作为裁判基础，无需原告进一步举证。例如，被告在庭审中明确承认“欠付原告货款50万元”，法院可直接认定该事实，除非存在法定例外。

2. 自认的撤回限制
   自认并非绝对不可撤销。根据《民事证据规定》第七条，当事人在法庭辩论终结前撤销自认的，需满足以下条件之一：

   • 经对方当事人同意；
     
   • 自认是在受胁迫或者重大误解情况下作出。
     若被告无法证明存在上述情形，法院一般不予准许撤回自认，已自认的事实仍作为裁判依据。

3. 涉及身份关系的事实除外
   根据《民事证据规定》第六十八条，涉及身份关系的事实（如婚姻状况、亲子关系等）不适用自认规则。即使被告自认“与原告存在婚姻关系”，法院仍需依据结婚登记等证据综合认定，不能仅凭自认定案。

4. 与查明事实不符时的处理
   若法院通过其他证据（如书证、物证、证人证言等）发现被告自认的事实与客观情况明显矛盾，法院可依据查明的事实作出裁判，不拘泥于自认。例如，被告自认“借款时间为2020年1月1日”，但银行转账记录显示实际借款时间为2020年2月1日，法院可否定自认时间。

实务建议：

• 被告在庭审中应谨慎陈述，避免随意承认对己不利的事实；
  
• 若需撤回自认，务必在法庭辩论终结前提出，并准备胁迫、重大误解等证据；
  
• 原告可利用自认规则固定关键事实，减少举证成本。
  

如有具体案件需分析，可直接向我提问。