鉴定意见未被采信时，鉴定费原则上由申请鉴定的当事人自行承担。以下从不同角度进行详细分析：

一、初始原则：“谁主张、谁负担”

在合同纠纷等诉讼中，鉴定费的承担遵循“谁主张、谁负担”的初始原则。这意味着，如果当事人为了证明自己的主张而申请鉴定，那么该当事人需要先垫付鉴定费用。这是基于诉讼中当事人对自己主张的举证责任而设定的规则。

二、鉴定意见被采信与未被采信的不同情况

1. 鉴定意见被采信：

   • 如果当事人申请的鉴定意见最终被法院采纳，并且该当事人的主张得到了支持，那么通常情况下，鉴定费会由败诉方承担。这是因为败诉方需要承担因其败诉而产生的合理费用，包括鉴定费。

2. 鉴定意见未被采信：

   • 如果当事人申请的鉴定意见未被法院采纳，那么该当事人需要自行承担鉴定费用。这是因为鉴定意见未被采信，意味着该鉴定并未对案件的审理产生实质性影响，因此申请鉴定的当事人需要自行承担其申请鉴定所产生的费用。

三、合同有约定的情况

在合同纠纷中，如果合同双方对鉴定费的承担有明确的约定，那么应当按照合同的约定来执行。这意味着，即使鉴定意见未被采信，但如果合同中约定了鉴定费由某一方承担，那么该方就需要按照合同的约定来支付鉴定费。

四、实际操作中的建议

1. 在申请鉴定前：

   • 当事人应当仔细考虑鉴定的必要性和可行性，以及鉴定费用可能带来的经济负担。
   • 如果可能的话，当事人可以在合同中明确约定鉴定费的承担方式，以避免后续产生纠纷。

2. 在鉴定意见未被采信后：

   • 当事人应当接受这一结果，并自行承担鉴定费用。
   • 如果当事人认为鉴定意见未被采信存在不公正或错误的情况，可以通过合法途径进行申诉或复议，但这并不改变鉴定费由申请方承担的原则。

举例说明：

假设在某合同纠纷中，甲方为了证明乙方违约而申请了鉴定，并垫付了鉴定费用。但最终法院审理认为，甲方提供的鉴定意见并未能充分证明乙方的违约行为，因此未采纳该鉴定意见。在这种情况下，甲方需要自行承担其申请鉴定所产生的费用。

综上所述，鉴定意见未被采信时，鉴定费原则上由申请鉴定的当事人自行承担。但具体承担方式还需根据合同约定和实际情况进行判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。