结论：按摩店客户申请退款的钱让员工赔，这一做法是否合理，需根据具体情况判断，但通常情况下，直接要求员工赔偿客户退款并不合理。
一、从合同关系角度分析
客户与按摩店的关系：客户与按摩店之间形成了服务合同关系。若客户因不满意服务等原因申请退款，这属于客户与按摩店之间的合同纠纷。根据合同相对性原则，合同纠纷应由合同双方（即客户和按摩店）解决，与员工个人无关。
员工与按摩店的关系：员工与按摩店之间是劳动关系。员工在提供服务过程中，若因个人过失或故意行为导致客户损失，按摩店有权根据内部规章制度或劳动合同对员工进行相应处理，但这并不意味着员工应直接承担客户退款的赔偿责任。
二、从责任承担角度分析
员工责任：员工在提供服务时，应尽到合理的注意义务。若因员工过失导致客户损失，员工可能需承担一定的内部责任，如警告、罚款、解雇等，但这并不等同于直接赔偿客户退款。
按摩店责任：作为服务提供者，按摩店应对其提供的服务质量负责。若客户因服务质量问题申请退款，按摩店应承担退款责任，而非将责任转嫁给员工。
三、从法律后果角度分析
违法性：直接要求员工赔偿客户退款，可能违反劳动法等相关法律法规。员工有权拒绝不合理的赔偿要求，并可通过法律途径维护自身权益。
劳动争议：若按摩店坚持要求员工赔偿，可能引发劳动争议。员工可向劳动争议调解委员会申请调解，或向劳动仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼。
四、建议与措施
内部处理：按摩店应建立完善的内部管理制度，明确员工在提供服务过程中的责任和义务。对于因员工过失导致的客户损失，按摩店可依据内部规章制度对员工进行相应处理，但应避免直接要求员工赔偿客户退款。
协商解决：对于客户申请退款的情况，按摩店应与客户进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。若协商无果，可依据合同约定或相关法律法规进行处理。
法律途径：若按摩店与客户之间的纠纷无法通过协商解决，双方可依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁，通过法律途径解决纠纷。
总结：按摩店客户申请退款的钱让员工赔，这一做法在通常情况下并不合理。按摩店应承担退款责任，并通过内部处理、协商解决或法律途径等方式妥善处理与客户之间的纠纷。若您在此方面遇到具体法律问题，可以直接向我咨询。