办理机器设备抵押时，签订《动产抵押合同》并依法办理抵押登记是有效的法律方式。具体分析如下：

1. 合同类型：动产抵押合同

• 根据《民法典》第三百九十五条，生产设备、原材料、半成品、产品等动产可以抵押。因此，机器设备属于法定抵押物范围，需签订书面《动产抵押合同》。
• 合同内容应明确：抵押物名称、数量、质量、状况、所在地、所有权归属，担保债权范围（本金、利息、违约金等），抵押期限，双方权利义务，违约责任等。

2. 生效要件：登记对抗主义

• 登记并非合同生效要件，但影响对抗效力：根据《民法典》第四百零三条，动产抵押权自合同生效时设立；未经登记，不得对抗善意第三人。
• 登记流程：抵押双方应共同向抵押人住所地的市场监督管理部门（原工商行政管理部门）办理动产抵押登记，提交主债权合同、抵押合同、抵押物清单等材料。

3. 注意事项

• 抵押物权属清晰：抵押人需对机器设备享有所有权或处分权，否则合同可能因无权处分而无效。
• 禁止重复抵押：同一机器设备不得同时为多个债权人设立抵押权（除非后抵押权人知悉并同意）。
• 抵押物保管义务：抵押期间，抵押人需妥善保管抵押物，未经抵押权人同意不得转让、出租或再抵押。
• 实现抵押权的条件：债务人不履行到期债务时，抵押权人可与抵押人协议以抵押物折价或拍卖、变卖所得价款优先受偿。

4. 特殊情形

• 浮动抵押：若企业以现有和将有的生产设备等动产设定抵押，可签订《浮动抵押合同》，但需在市场监督管理部门登记，且抵押财产在抵押期间可能变动。
• 最高额抵押：若为一定期间内连续发生的债权提供担保，可签订《最高额动产抵押合同》，明确最高债权额限度。

建议：签订合同前，务必核实抵押物权属、评估价值，并依法办理登记。如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程或合同条款审查。