合伙人转让财产份额部分支付对价但未变更合伙人变更备案的，该转让行为在内部关系上可能有效，但在外部关系上可能面临一定风险，具体效力需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、内部关系角度
转让协议的效力：
- 合伙人之间转让财产份额，通常基于双方的真实意思表示签订转让协议。若该协议内容合法、不违反法律法规的强制性规定，且不存在欺诈、胁迫等情形，则转让协议在合伙人之间是有效的。
- 部分支付对价并不影响转让协议的成立，只要双方对支付方式、金额等达成一致，且符合合同法的相关规定，协议即具有法律效力。
未变更备案的影响：
- 合伙人变更备案是工商行政管理的要求，旨在公示合伙企业的合伙人信息，保护交易相对人的利益。然而，未变更备案并不直接影响合伙人之间转让财产份额的内部效力。
- 在内部关系上，只要转让协议有效，且双方已实际履行（如部分支付对价），则转让行为在合伙人之间即产生法律效力。未变更备案可能导致在对外关系上产生一定风险，但不影响内部转让的效力。
二、外部关系角度
对第三人的影响：
- 未变更合伙人变更备案可能导致合伙企业的外部交易相对人无法及时了解合伙人变更情况，从而影响其交易决策。
- 若第三人因信赖工商登记信息而与合伙企业进行交易，后因合伙人变更问题产生纠纷，合伙企业可能需承担一定的法律责任。
法律风险：
- 根据相关法律法规，合伙企业应当依法办理变更登记。未办理变更登记的，可能面临行政处罚等法律风险。
- 在涉及外部交易时，未变更备案可能导致合伙企业无法充分证明其合伙人变更情况，从而增加诉讼或仲裁中的举证难度。
三、法律建议
完善转让手续：
- 合伙人之间转让财产份额时，应签订详细的转让协议，明确双方的权利义务、支付方式、金额等条款。
- 转让完成后，应及时办理合伙人变更备案手续，以确保合伙企业的合法性和交易相对人的利益。
注意法律风险：
- 在未办理变更备案前，合伙企业应谨慎处理与外部交易相对人的关系，避免因信息不对称而产生纠纷。
- 若已发生因未变更备案而产生的纠纷，合伙企业应积极收集证据，证明转让行为的合法性和有效性，以维护自身权益。
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