建筑工程防水单独分包是否合法，需视具体情况而定。以下从合法与违法两种情形进行详细分析：
合法分包情形
合同约定或发包人认可：
- 若在总承包合同中明确约定了防水工程可以单独分包，或者经发包人（建设单位）同意或认可，则防水工程单独分包是合法的。
非主体结构工程：
- 防水工程通常不属于建筑工程的主体结构部分。根据法律规定，总承包人可以将非主体结构的工程分包给具有相应资质的分包单位。因此，若防水工程被明确为非主体结构工程，且满足其他条件，则单独分包合法。
分包人资质：
- 分包人必须具备相应的资质条件。对于防水工程，分包人应持有防水工程专业承包资质或其他相关资质。若分包人具备相应资质，则单独分包合法。
禁止再分包：
- 分包人不得将其承包的工程再分包。若防水工程分包后，分包人未进行再分包，则单独分包合法。
违法分包情形
未经发包人认可：
- 若总承包合同中未约定防水工程可以单独分包，且未经发包人同意或认可，而总承包人擅自将防水工程分包给其他单位，则构成违法分包。
主体结构工程分包：
- 若防水工程被错误地认定为建筑工程的主体结构部分，并据此进行分包，则构成违法分包。因为根据法律规定，建筑工程主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。
分包人无资质：
- 若分包人不具备相应的资质条件，如未持有防水工程专业承包资质或其他相关资质，而承接防水工程分包，则构成违法分包。
再分包：
- 若分包人将其承包的防水工程再分包给其他单位，则构成违法分包。因为法律规定禁止分包单位将其承包的工程再分包。
法律建议
- 审查合同与资质：在进行防水工程分包前，总承包人应仔细审查总承包合同中的相关条款，确保分包行为符合合同约定。同时，应核实分包人的资质条件，确保其具备承接防水工程的能力。
- 获得发包人认可：若总承包合同中未约定防水工程可以单独分包，总承包人应在分包前获得发包人的同意或认可，以避免违法分包的风险。
- 遵守法律规定：总承包人和分包人应严格遵守相关法律法规的规定，不得进行违法分包行为。否则，将可能面临行政处罚、民事赔偿等法律后果。
若您在建筑工程防水分包方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。