《中华人民共和国政府采购法》并未明确规定缴纳履约保证金后才签订协议。不过，根据《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例的相关规定，以及政府采购实践中的通常做法，我们可以对这一问题进行如下分析：
一. 履约保证金的相关规定
履约保证金的定义与目的
- 履约保证金是大型招标项目、工程招标、政府采购项目等中，为防止不确定性和风险，考察中标单位实力，并确保中标单位按合同履行义务的一种特殊措施。它具有控制合同有效执行与风险防范的功能。
履约保证金的提交要求
- 根据《中华人民共和国招标投标法》第四十六条第二款，若招标文件要求中标人提交履约保证金，则中标人必须按要求提交。这是确保工程质量和工期的一项法律制度，采购人可在招标文件中运用此制度来保障自身权益。
履约保证金的退还
- 《标准施工招标文件》中通用合同条款规定，承包人应保证履约担保在发包人颁发工程接受证书前一直有效。发包人应在工程接受证书颁发后28天内退还履约担保给承包人。
二. 采购协议签订与履约保证金的关系
协议签订的时间节点
- 根据《中华人民共和国政府采购法》及相关法律法规，采购人与中标供应商应当在中标通知书发出后的一定时间内（通常为三十日内），按照招标文件和中标供应商的投标文件订立书面合同。
履约保证金与协议签订的关系
- 虽然《中华人民共和国政府采购法》并未明确规定缴纳履约保证金后才签订协议，但在实践中，采购人通常会在招标文件中明确要求中标供应商在签订协议前提交履约保证金。这是为了确保中标供应商有能力和意愿按照合同约定履行义务，从而保障采购项目的顺利进行。
特殊情况处理
- 如果中标供应商无正当理由不与采购人签订合同，或不按要求提交履约保证金，采购人有权取消其中标资格，并可能不予退还投标保证金。
三. 我的观点
- 虽然《中华人民共和国政府采购法》没有直接规定缴纳履约保证金后才签订协议，但根据《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例的相关规定，以及政府采购实践中的通常做法，可以推断出在实践中，采购人通常会在中标供应商提交履约保证金后，再与其签订正式的采购协议。这是为了确保采购项目的顺利进行，并保障采购人的合法权益。
我建议：在参与政府采购项目时，供应商应仔细阅读招标文件中的相关条款，明确履约保证金的提交要求和退还条件，以及协议签订的时间节点和具体要求。如有任何疑问或不明确之处，应及时向采购人或采购代理机构咨询并寻求解答。