在刑事案件中，如果原告和被告达成和解，被告是否会留下案底，这需要根据案件的具体性质和情节来判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 自诉案件的情况：

   • 如果案件是自诉案件，且和解后原告撤回起诉，案件没有经过法院实体审判，那么被告不会被判刑，也就不会留有案底。

2. 公诉案件的情况：

   • 对于公诉案件，即使双方达成和解协议，案件通常还是会经过司法程序处理。公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议，人民检察院也可以向人民法院提出从宽处罚的建议。但这并不意味着被告不会留下案底。
   • 如果犯罪情节轻微，不需要判处刑罚，且双方达成和解协议，检察院可以作出不起诉的决定。在这种情况下，被告不会经过法院的审判，自然也就不会被判刑，不会留有案底。
   • 然而，如果涉及的罪行属实，即便是当事人之间已经达成和解，在量刑环节或许能够得到适当减轻的优待，但案底仍然会存在。因为犯罪行为已经发生，且相关的司法程序需要依法严格执行。

3. 法律背景与建议：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，以及《关于建立犯罪人员犯罪记录制度的意见》，犯罪记录会被合理登记和有效管理。这既有助于国家有关部门充分掌握与运用犯罪人员信息，也有助于保障有犯罪记录的人的合法权利，帮助其顺利回归社会。
   • 对于被告而言，即使达成和解并可能获得从宽处理，也应认识到犯罪行为的严重性，并积极采取措施弥补过错，争取更好的社会评价和未来机会。
   • 如果有关于刑事案件和解后案底问题的进一步疑问或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。

综上所述，刑事案件中原告和被告达成和解后，被告是否会留下案底取决于案件的具体性质和情节。在自诉案件中，如果原告撤回起诉且案件未经实体审判，被告通常不会留有案底；而在公诉案件中，即使达成和解，被告也可能会留下案底，除非犯罪情节轻微且检察院作出不起诉的决定。